Toiminnallista hajoamista käytetään usein liiketoimintaprosessien eri osien ymmärtämiseen, ja se on yleensä osa projektien suunnittelua, analysointia ja suunnittelua. Liiketoiminta voidaan ymmärtää paremmin, kun hierarkkinen kaavio, jota kutsutaan toiminnalliseksi hajoamiskaavioksi, luettelee yrityksen eri toiminnot ylhäältä alas. Liiketoimintojen tasojen lukumäärä voidaan yleensä jakaa toiminnan monimutkaisuuden ja koon mukaan. Tällainen analyysi voidaan suorittaa tiedon esittämiseen, jota käytetään usein tekoälysovelluksissa, sekä tietokannan normalisoinnin aikana tietojen järjestämiseksi.
Tietorakennetta koneoppimisessa kehitetään usein toiminnallisen hajoamisen avulla. Bayes -verkot, jotka tyypillisesti piirtävät todennäköisyydet satunnaismuuttujien perusteella, voivat hajottaa tietoja yhdistettyjen tietojen välillä syyn perusteella. Järjestelmän tärkeimmät yksityiskohdat luetellaan yleensä ensin, kun taas yhdistetyt osajoukot luetellaan kullakin seuraavalla tasolla. Jos funktio on riippuvainen toisesta, molempien sanotaan olevan kytkettyjä. Löysä kytkin tarkoittaa tyypillisesti sitä, että yhtä toimintoa voidaan muuttaa ilman, että sillä on suurta vaikutusta seuraavaan.
Kun yhden toiminnon muutokset muuttavat suoraan muita, sitä kutsutaan koheesioksi. Toiminnot, joilla on korkea yhteenkuuluvuus, on yleensä sidottu yhteen tavoitteeseen; siksi prosessi voi olla helpompi ymmärtää. Kun toiminnallinen hajoaminen suoritetaan hyvin, on yleensä hyödyllistä ymmärtää, miten järjestelmän prosessit korreloivat. Kaavion yksittäiset yksiköt voivat myös tunnistaa kunkin toiminnon yksityiskohdat ja vaatimukset, kun taas virheitä voi löytyä tietystä alueesta, joten ne eivät heijastu koko järjestelmään.
Organisaation toiminnan ymmärtäminen joskus estyy, kun toiminnallinen hajoaminen suoritetaan väärin tai tehottomasti. Erityisesti päällekkäiset prosessit ja toiminnot ovat joskus ongelmallisia tässä tapauksessa, mikä voi tehdä joidenkin liiketoimintayksiköiden tarkoituksen epäselväksi; prosessien väliset yhteydet voivat olla myös monimutkaisia. Toiminnallinen hajoaminen toteutetaan yleensä parhaiten, kun järjestetään kokouksia asianmukaisten liikekumppaneiden kanssa.
Järjestelmäsuunnittelun lohkokaaviot luodaan usein käyttämällä toiminnallista hajoamista. Esimerkiksi elektronisten laitteiden toimintoja ja komponentteja voidaan vaihtaa graafisten lohkojen sisällä analyysin luomiseksi järjestelmää muokattaessa. Tietokoneohjelmointi on toinen toiminnallisen hajoamisen sovellus, jota käytetään usein prosessien jakamiseen hallittaviksi komponenteiksi. Samanlaisia menetelmiä käytetään toisinaan tilastoissa, varsinkin kun jotkin muuttujat matemaattisessa mallissa häiritsevät muita.