Troijalainen vakoiluohjelma, joka on yksityisyyttä loukkaava ohjelmisto, joka on nimetty suositusta kreikkalaisesta tarusta Troijan hevosesta, pääsee tietojärjestelmiin samalla, kun se on naamioitu vaarattomaksi. Tämän haittaohjelman asentamisen jälkeen ohjelma suorittaa minkä tahansa määrän haitallisia toimintoja tekijän halutun aikomuksen mukaan, mutta vakoiluohjelmat seuraavat ensisijaisesti tietokoneen käyttäjiä koskevia tietoja. Vaikka Troijan vakoiluohjelmat ovat yleensä piilotettuja ja huomaamattomia, niiden uskotaan heikentävän tietokoneen puolustuskykyä, mikä lisää uusien invasiivisten ohjelmien todennäköisyyttä. Vakoiluohjelmilta puuttuu virusten ja matojen replikointiominaisuudet, mutta troijalainen voidaan siirtää järjestelmästä toiseen liittämällä se ladattavaan kohteeseen tai toiseen infektioon. Riittävän tietoturvan on sisällettävä jonkinlainen vakoiluohjelmien torjuntaohjelma.
Ihmiset voivat tietämättään ladata Troijan vakoiluohjelmia monin tavoin. Yksilöt saattavat hankkia ohjelmiston ystävältä toiselle välitetystä sähköpostivitsistä tai lataamalla suosittu kuva. Joskus verkkosivustolle ilmestyy ponnahdusikkuna, joka varoittaa, että tietokone sai vakavan viruksen. Mainoksessa ehdotetaan välitöntä tarkistusta ja se houkuttelee käyttäjiä lataamaan tuotteen, jonka väitetään suojaavan käyttäjän tietokonetta. Useammin kuin ei, Troijan vakoiluohjelmat ovat kuitenkin latauksen mukana.
Troijalainen vakoiluohjelma, joka toimii salaa taustalla tietokoneen käytön aikana, voi seurata käyttäjän surffauskäyttäytymistä. Nämä yksityiskohtaiset tiedot verkkotoiminnasta siirretään usein toiselle tietokoneelle mainontaa ja markkinointia varten. Jotkut vakoiluohjelmat ohjaavat käyttäjien verkkoselaimet tai vievät yksilöitä tietyille sivustoille. Kun Troijan vakoiluohjelmia käytetään identiteettivarkauksiin, ne piilevät kulissien takana keinona kerätä erilaisia arvokkaita henkilökohtaisia tietoja. Varkaat odottavat usein saastuneita tietokoneita paljastamaan nimet, tilit, luottokorttien numerot, tunnistenumerot, tiedostot ja salasanat.
Arkaluonteisten tietojen paljastamisen lisäksi troijalainen vakoiluohjelma saattaa avata oven muille haittaohjelmille. Jokainen lisäinfektio alkaa vaikuttaa järjestelmän suorituskykyyn. Tietokoneet voivat jäätyä käytön aikana tai vakoiluohjelmat voivat hidastaa tietokonetta. Aivan kuten viruksen oireet, järjestelmä ei välttämättä käynnisty tai kaatuu. Troijan vakoiluohjelmat yhdessä muiden haittaohjelmien kanssa voivat purkaa palomuurit tai tehdä virustentorjuntaohjelman tehottomaksi.
Yksilöt saattavat turvautua tietokoneen täydelliseen puhdistukseen asentamalla käyttöjärjestelmä ja muut tarvittavat ohjelmat uudelleen. Vakoiluohjelmasuojauksen sisällyttäminen osana verkkoturvaa estää monia tauteja. Jotkut virustentorjuntaohjelmat tarjoavat vakoiluohjelmasuojauksen, mutta monet muut eivät. Tehokas vakoiluohjelmisto ei ainoastaan suojaa tietoja, vaan myös varmistaa optimaalisen tietokoneen toiminnan. Vakoiluohjelmien esto- ja vakoiluohjelmien poisto -ohjelmat etsivät käyttöjärjestelmän tiedostoista, rekistereistä ja asennetuista ohjelmistoista merkkejä mahdollisista uhista.
Vakoiluohjelmien torjuntaohjelmat ovat saatavana ilmaisena latauksena tai oston yhteydessä, ja niissä on erilaisia ominaisuuksia. Jotkut niistä toimivat reaaliajassa ja varoittavat käyttäjiä mahdollisista uhkista surffaillessaan verkossa. Yksinkertaiset ohjelmat edellyttävät manuaalisesti valittua skannausta, ja kehittyneemmät ohjelmistot antavat käyttäjille mahdollisuuden ajoittaa säännölliset tarkistukset. Skannauksen päätyttyä ohjelmat tarjoavat yleensä luettelon epäillyistä uhista sekä mahdollisen haitallisen tiedoston säilyttämisen tai poistamisen.