Trooppisten kalojen hautomo on säiliö tai suurempi laitos, jossa trooppisia kaloja haudotaan ja annetaan kasvaa kontrolloidussa ympäristössä. Kalanjalostusmaailmassa trooppisia kaloja ovat ne, jotka voivat elää akvaariossa, jossa on makeaa vettä, toisin kuin merikalat, jotka tarvitsevat suolavettä akvaariossaan. Hautomo tuottaa toukkia trooppiselle kalateollisuudelle. Kalat myydään sitten henkilöille, joilla on oma makeavesisäiliöjärjestelmä. Trooppisten kalojen hautomo voi olla pieni sisäkäyttö ja joskus useita suuria ulkouima -altaita.
Jatkuvasti suodatetulla ja lämpötilakontrolloidulla vedellä kalat voidaan haudata ympäri vuoden. Ilman hautomoita trooppisia kaloja olisi myynnissä paljon vähemmän kuin tällä hetkellä saatavilla. Pienemmät hautomotoiminnot tarvitsevat vain muutamia säiliöitä, joissa on riittävä vedenvirtaus ja suodattimet. Suuremmissa tiloissa on usein säiliöitä poikimista ja kutua varten, laboratorioita geneettiseen manipulointiin ja valikoivaan jalostukseen sekä useita henkilökunnan jäseniä suorittamaan herkkä operaatio. Broodstock on ryhmä kypsiä kaloja, jotka on valittu erityisesti jalostustarkoituksiin ja trooppisten kalojen hautomon uudelleenasuttamiseen.
Joillakin trooppisilla kaloilla on erilaiset kutu- ja lisääntymistavat. Esimerkiksi pellekala kutee aina myöhään iltapäivällä. Munat poistetaan sitten kutuastiasta ja sijoitetaan toiseen säiliöön poissa vanhemmista. Toukkojen kuoriutuminen vaatii vähintään tunnin pimeyden, ja jos valoa putoaa muniin, jäljellä olevat toukat odottavat seuraavan pimeyden ajan kuoriutumista.
Tässä vaiheessa toukat ovat liian pieniä syömään mitään suurempaa kuin pienet vesieläimet, joita kutsutaan rotifereiksi tai pyöräeläimiksi. Pyörivät levitetään tasaisesti trooppisten kalojen hautomoihin ja toukat alkavat ruokkia välittömästi. Jatkuva ruokinta kahden tai kolmen tunnin välein tuottaa tyypillisesti kovimpia ja kirkkaimpia trooppisia kaloja. Kestää muutaman päivän, ennen kuin nuoret kalat pystyvät ruokkimaan suolaveden katkarapuja, jotka ovat vähäisiä äyriäisiä. Noin viikon kuluttua pienet kalat ovat yleensä valmiita syömään hiutaleista valmistetuista suolavedistä valmistettua ruokaa.
Lukuisten säiliöveden muutosten jälkeen nuoret kalat alkavat ilmaista trooppisia värejään. Tässä vaiheessa vahvemmat ja isommat kalat siirretään toiseen säiliöön, jotta heikommille kaloille annetaan hyvät mahdollisuudet kehittyä. Kalaa ei koskaan siirretä verkon avulla, koska se voi tappaa ne. Ne siirretään yleensä kupin tai pussin avulla. Munien ja toukkien kasvattamiseen ja hoitoon liittyy monia yksityiskohtia, mutta nämä perusvaiheet ovat yhteisiä useimmille trooppisten kalojen hautomoille.