Vagotomia viittaa useisiin muunnelmiin leikkauksesta, joka toimii vagus -hermossa. Tämä on erittäin pitkä aivoista ulottuva hermo, joka inervoi kehon osia, kuten sydämen ja myös vatsan. Kun tästä leikkauksesta keskustellaan, se tarkoittaa tämän hermon alimman osan leikkaamista tai muuttamista siten, että sen vaikutus mahahapon muodostumiseen ja mahalaukun toimintaan lopetetaan. Kehityksen aikana tärkein syy tämän leikkauksen suorittamiseen oli haavaumien hoito, ja tämä on nyt harvinaisempaa. Sen sijaan leikkausta tutkitaan, koska se näyttää vähentävän nälkää ja sillä voi olla positiivinen vaikutus laihtumiseen.
Syy siihen, että vagotomia on suurelta osin hylätty peptisten haavaumien hoitoon, johtuu pääasiassa paremmasta ymmärryksestä haavaumista. Monia näistä voidaan hoitaa tehokkaasti antibiooteilla ja lääkkeillä, jotka säätelevät happo -olosuhteita. Kaikki ihmiset eivät reagoi lääkehoitoon, ja kun haavaumat ovat merkittäviä, lääkärit saattavat silti suositella tätä leikkausta keinona hallita haavaumia. Se pyrkii poistamaan haavaumat, ja se osoittaa myös uusien haavaumien kehittymisen vähenemisen ajan myötä. Se voidaan myös yhdistää jonkin verran mahalaukun poistamiseen.
Vagotomia voidaan suorittaa useilla tavoilla ja kirurgit voivat kukin valita. Yksi menetelmä, joka on usein edullinen, on resektoida tai poistaa vain vagushermon osat, jotka toimittavat mahalaukun. Tätä kutsutaan selektiiviseksi leikkaukseksi, ja sitä voidaan parantaa entisestään, jos vielä pienempi osa hermoista poistetaan. Tavoitteena on olla resektion suhteen hyvin spesifinen, niin että vagushermon pienimmät osat poistuvat. Tämän tyyppiset leikkaukset suoritetaan usein laparoskooppisesti.
Toipuminen vagotomiasta voi silti olla pitkä, ja ihmiset voivat olla sairaalassa viikon tai pidempään. Vatsan saaminen tyhjentymään kunnolla voi olla vaikeaa, ja leikkauksella voidaan suorittaa muita toimenpiteitä, joilla edistetään vatsan parempaa tyhjenemistä tai vältetään polkumyynniksi kutsuttu tila, jossa keho lähettää yhtäkkiä suurimman osan suolen sisällöstä suolistoon aiheuttaen kipua, vakavaa ripuli ja pyörtymisen tunne. Ihmiset voivat odottaa yhteensä noin kuuden viikon toipumista ennen kuin he voivat jatkaa normaalia toimintaa.
Vaikka haavaumien vagotomiaa käytetään harvemmin, vagushermon resektioon on ehdotettu toista käyttöä. Lääkärit tutkivat tämän leikkauksen taipumusta vähentää ruokahalua huomattavasti, mikä saattaa tehdä siitä erittäin houkuttelevan lihaville tai joilla on vaikeuksia hallita sitä. Varhaiset tutkimustulokset 2000 -luvun lopulla viittaavat siihen, että tämä toimii joillekin ihmisille, mutta ei kaikille ihmisille. On vielä liian aikaista tehdä johtopäätöksiä siitä, olisiko vagotomia tarkoituksenmukainen painonpudotushoitona ja onko se ehkä yhdistettävä muihin mahalaukun leikkauksiin, kuten bariatric -leikkaukseen tai sidokseen parhaiden tulosten saavuttamiseksi.