Ajatus viisasten kivestä on yleinen eurooppalaisessa mytologiassa. JK Rowling lainasi ajatuksen alkemiallisesti luodusta kivestä, jolla on maagisia ominaisuuksia, suosittuun Harry Potter -sarjaansa. Harry Potter -kirjoissa on vain yksi viisasten kivi, jonka Nicolas Flamel loi 1400 -luvulla. Flamelin kivi pystyy muuttamaan esineet kullaksi ja tuottamaan elämän eliksiirin, joka antaa juomalle kuolemattomuuden.
Maaginen esine ilmestyi ensin Harry Potter and the Philosopher’s Stone -elokuvassa, joka julkaistiin nimellä Harry Potter and the Sorcerer’s Stone Yhdysvalloissa. Scholastic, amerikkalainen Harry Potter -kirjojen kustantaja, uskoi, että amerikkalaisia lukijoita ei kiinnostaisi kirja ”viisasten kivestä”. Tätä valintaa on kritisoitu yhdessä Yhdysvalloissa julkaistujen Harry Potter -kirjojen amerikkalaistamisen kanssa: pieniä muutoksia tehtiin kielellä, jota hahmot käyttivät pelosta, että amerikkalaiset eivät ymmärtäisi sitä.
Viisasten kivi on tärkeä osa kirjaa. Nicolas Flamel on Albus Dumbledoren ystävä, Tylypahkan noituuden ja velhojen koulun rehtori. Molemmat ovat työskennelleet yhdessä alkemiaprojekteissa, oletettavasti yhteistyössä viisasten kiven kanssa tutkiakseen sen ominaisuuksia. Flamel kääntyy myös Dumbledoren puoleen pitääkseen kiven turvassa, ja kirjan alkupuolella se siirretään holvista 713 Gringottsissa Tylypahkaan, missä sen oletetaan olevan turvallisempaa.
Yhteistyössä koulun useiden opettajien kanssa Dumbledore asettaa joukon esteitä viisasten kiven tielle sen suojelemiseksi. Lumottujen suojien sarja on suunniteltu estämään Voldemort saamasta viisasten kiveä, koska Dumbledore on huolissaan Voldemortin noususta. Viime kädessä Voldemort pystyy tunkeutumaan kaikkiin suojauksiin viimeistä lukuun ottamatta: Dumbledore kätkee taitavasti kiven Erised Mirrorin sisällä niin, että vain joku, joka haluaa löytää viisasten kiven, mutta ei käytä sitä, voi saada sen.
Harjoituksissa, jotka käsittelevät tavoitteita ja motiiveja, Harry saa sen, koska hän katsoo peiliin ilman aikomusta käyttää sitä, ja vastustaa myös onnistuneesti Voldemortin yritystä ottaa Filosofin kivi väkisin. Tämän huipentuman jälkeen viisasten kivi tuhotaan estääkseen Voldemortin saamasta sitä, ja Nicolas Flamel ja hänen vaimonsa valmistautuvat kuolemaansa. Harry on aluksi huolissaan näistä kahdesta, mutta Dumbledore huomauttaa, että Flamel on ollut elossa yli kuusisataa vuotta ja on luultavasti valmis jatkamaan kuoleman “seuraavaa suurta seikkailua”.