Virtsan sepsiksen hoito riippuu sairauden vaiheesta, joka on komplikaatio kehon infektiosta. Useita lääkkeitä voidaan tarvita ongelman hoitamiseksi varhaisessa vaiheessa ja aggressiivisesti. Tarkka seuranta ja leikkaus voivat olla tarpeen vakavampien virtsasepsis -tapausten varalta. Hoito varhaisessa vaiheessa lisää potilaan mahdollisuuksia selviytyä, kun taas oireiden huomiotta jättäminen voi johtaa septiseen sokkiin tai kuolemaan.
Diagnosoidessaan virtsan sepsiksen lääkäri määrää potilaalle tietyntyyppisiä infektion hoitoon tarkoitettuja lääkkeitä. Laajakirjoisia antibiootteja annetaan yleensä suonensisäisesti, jotta päästäisiin eroon tavallisista bakteereista, jotka aiheuttavat sairauksia kehossa. Lääkäri seuraa sitten lisäverikokeita sepsiksen aiheuttavan bakteerien tietyn lähteen tunnistamiseksi. Kun tulokset ovat saatavilla, potilas voi vaihtaa uuteen antibioottiin tiettyä infektiolähdettä varten.
Tarvittaessa lääkäri voi määrätä myös muita lääkkeitä verenpaineen ja verensokerin hallitsemiseksi. Vasopressorit auttavat hoitamaan sepsispotilaita, joiden verenpaine laskee vaarallisen alhaiselle tasolle. Nämä lääkkeet pitävät verenpaineen hallinnassa supistamalla kehon verisuonia. Insuliinia voidaan myös määrätä verensokerin vakauttamiseksi hoidettaessa virtsan sepsistä.
Myös muihin infektioon liittyviin oireisiin on kiinnitettävä huomiota. Lääkäri voi antaa lääkkeitä immuunijärjestelmän heikentymisen estämiseksi. Pieniannoksisia kortikosteroideja voidaan tarjota tulehduksen hoitoon, kun taas rauhoittavat ja kipulääkkeet auttavat lievittämään sairauden aiheuttamaa epämukavuutta.
Nestepohjaista hoitoa voi olla myös varattuna potilaille, joilla on vaikea virtsasepsis. Hoidon aikana potilaat saavat useita määriä laskimonsisäisiä nesteitä kehon lisävaurioiden estämiseksi. IV -nesteet auttavat suojaamaan elintärkeitä elimiä sekä säätelemään verenpainetta, jotta potilas ei joudu shokkiin. Erään lääketieteellisen resurssin mukaan sepsiksen hoitoon käytetyt vakiotyyppiset IV -nesteet sisältävät kristalloideja ja kolloideja. Kristalloidit koostuvat vesiliukoisesta suolaliuoksesta, joka tulee verenkiertoon, kun taas kolloidit on valmistettu paksummasta, vaikeammin liukenevasta aineesta, kuten verestä.
Potilaasta ja sepsiksen vakavuudesta riippuen muita hoitoja ja toimenpiteitä voidaan käyttää kehon muiden toimintojen suojaamiseksi. Esimerkiksi hengityslaitteen happi voi auttaa potilasta hengittämään helposti. Munuaisdialyysi voidaan myös antaa auttaa munuaisia suodattamaan toksiineja verestä. Joissakin tapauksissa leikkausta voidaan tarvita paiseiden tai mätän poistamiseksi sekä infektiolähteen poistamiseksi.