Mikä on Western Blot?

Western blot on laboratorioanalyysitekniikka, jota käytetään proteiinien eristämiseen. Sitä voidaan käyttää tiettyjen sairauksien diagnosointiin ja myös eri proteiinien ja prosessien tutkimukseen. Tunnetusti Western blot liittyy HIV -infektion diagnosointiin, mutta sitä voidaan käyttää myös naudan spongiformisen enkefaliitin (BSE) ja Lymen taudin jälkien etsimiseen. Näytteet, jotka on lähetetty testattavaksi Western blot -protokollalla, voivat palauttaa tulokset muutamasta päivästä useisiin viikkoihin riippuen laboratorion kapasiteetista ja kiireellisyydestä.

Western blot -menetelmässä näyte, joka voi olla peräisin verestä tai kudoksesta, pannaan ensin elektroforeesiin siten, että proteiinit erottuvat pituuden mukaan. Elektroforeesigeelin nauhaa, jossa on kohdepituisia eristettyjä proteiineja, voidaan käyttää proteiinien siirtämiseen nitroselluloosasubstraatille testin seuraavaa vaihetta varten. Tässä vaiheessa näytteeseen lisätään vasta -aine, jonka tarkoituksena on merkitä proteiinit antigeeneihin, joihin vasta -aine lukittuu.

Kun proteiinit on merkitty, ne voidaan helposti tunnistaa. Tautitestin tapauksessa reaktiivisen proteiinin läsnäolo osoittaa, että näyte on positiivinen. Western -blotit palauttavat harvoin vääriä positiivisia tuloksia, vaikka se voi tapahtua joskus, ja ne voivat myös palauttaa vääriä negatiivisia tuloksia, joissa henkilöllä todella on sairaus, mutta se ei näy Western blot -testissä. Tämä voi olla erityisen yleistä tapauksissa, joissa tautia aiheuttava aine ei ole vielä alkanut lisääntyä.

Tutkijat voivat käyttää tuloksia tunnistaakseen tiettyjä proteiineja, joita he seuraavat, ja moniin muihin tarkoituksiin. Western blot -protokollan toiminnan ymmärtäminen on tärkeä taito joillekin tutkijoille ja laboratorioteknikoille, koska heidän on kyettävä palauttamaan luotettavia ja luotettavia tuloksia tällä menetelmällä. Laboratoriotaidot, kuten monimutkaisten tai huonojen näytteiden käsittelyn oppiminen ja kontaminaation välttäminen prosessin aikana niin, että testitulosten tiedetään olevan totta.

Tätä tekniikkaa kutsutaan joskus immunoblotiksi, koska olennaisesti halutut proteiinit “blotataan” vasta -aineilla niin, että ne näkyvät. Tätä testiä voidaan käyttää proteiinien etsimiseen kaikista eläimistä, ei pelkästään ihmisistä, ja eläinlääkärit käyttävät usein Western blot -testiä sen määrittämiseksi, onko lehmakarja saanut tartunnan tai altistunut BSE: lle.