Tärkein yhteys aamupahoinvoinnin ja keskenmenon välillä on se, että naisilla, joilla on pahoinvointia ja oksentelua raskauden aikana, on pienempi riski raskauden menetyksestä. Lisäksi naisilla, joilla ei ole lainkaan sairautta, on hieman suurempi riski saada keskenmeno verrattuna naisiin, joilla on vaikea tai kohtalainen pahoinvointi. Syytä, miksi näin on, ei täysin ymmärretä, koska kukaan ei tiedä tarkasti, mikä aiheuttaa aamupahoinvointia.
On olemassa useita teorioita siitä, miksi aamupahoinvointi ja keskenmeno harvoin menevät yhteen. Ensimmäinen on se, että sairaus raskauden aikana on merkki siitä, että hormonit lisääntyvät helposti ja aiheuttavat reaktioita naisen kehossa. Normaalien raskausoireiden puute, kuten pahoinvointi, voi olla merkki siitä, että hormonitasot eivät nouse niin kuin pitäisi. Nämä hormonit, pääasiassa progesteroni ja estrogeeni, ovat välttämättömiä kuukautisten estämisessä ja terveen raskauden tukemisessa. Näiden hormonien puute voi aiheuttaa sen, että keho ei ymmärrä olevansa raskaana ja keskeyttää raskauden spontaanisti.
Toinen teoria aamupahoinvoinnista ja keskenmenoista kertoo, että pahoinvointi ja oksentelu raskauden aikana ovat luonnon tapa varmistaa, ettei äiti syö mitään haitallista. Oksentelu voi myös auttaa puhdistamaan mahalaukun mahdollisesti haitallisista taudinaiheuttajista. Tätä teoriaa ei tueta kovinkaan osittain siksi, että monta kertaa nainen sairastuu ajatukseen syödä terveellistä ruokaa ja sietää roskaruokaa hyvin.
Ei ole täysin tiedossa, onko aamupahoinvoinnin vakavuuden ja keskenmenon välillä korrelaatiota. Tyypillisesti ei ole tiettyä määrää sairauksia, joita pidetään “terveinä” tai “epäterveellisinä”, kunhan äiti kykenee edelleen syömään ja ravitsemaan kehoaan eikä tule kuivumaan. Sen lisäksi naiset kokevat pahoinvointia raskauden aikana eri tasoilla ja pitkiä aikoja ilman ilmeistä yhteyttä raskauden terveyteen.
On kuitenkin paljon naisia, jotka eivät kokene aamupahoinvointia tai pahoinvointia ollenkaan ja hankkivat terveitä vauvoja. On mahdollista, että jos hormoniteoria olisi totta, nämä naiset voivat yksinkertaisesti reagoida paremmin hormonien lisääntymiseen kuin useimmat. Toinen mahdollisuus on, että nämä naiset syövät terveellisemmin ja välttävät riskialttiita ruokia ja muita aineita, ja heillä saattaa olla vähemmän tarvetta oksentelun ja pahoinvoinnin lisäsuojaan. Voi myös olla, että vauva tai istukka tuottaa hormoneja tai entsyymejä, jotka aiheuttavat joillakin naisilla sairauden ja toiset eivät.