Epäsäännölliset kuukautiset ja syntyvyyden hallinta voivat liittyä hyvin läheisesti toisiinsa. Kun potilaat valittavat lääkäreilleen epäsäännöllisistä kuukautisista, yksi ensimmäisistä kysymyksistä on, onko potilas äskettäin aloittanut, lopettanut tai muuttanut hormonaalista ehkäisymenetelmää. Yleensä hormonaaliseen ehkäisyyn liittyvät epäsäännölliset ajanjaksot ovat hyvänlaatuisia, vaikka ne voivat häiritä potilasta. Jos niistä tulee jatkuva ongelma, arviointia voidaan suositella muiden epäsäännöllisten kuukautisten mahdollisten syiden selvittämiseksi.
Kuukautiskierto, joka kestää 28 päivää useimmilla naisilla, on kehon hormonien säätelemä. Kun ihmiset esittävät hormoneja hormonaalisen syntyvyyden muodossa, ei ole harvinaista, että kuukautisia esiintyy epäsäännöllisesti. Joissakin tapauksissa uuden menetelmän ensimmäiset kuukaudet voidaan merkitä epäsäännöllisillä ja odottamattomilla kuukautisilla, kunnes keho sopeutuu. Kun joku on vakiintunut syntyvyyden hallintaan, kuukautiset voivat itse asiassa saada säännöllisempiä, ja joskus hormonaalinen ehkäisy määrätään hoitoon ihmisille, joilla on epäsäännöllinen sykli. Lääkärit ovat tietoisia epäsäännöllisten kuukautisten ja syntyvyyden välisestä yhteydestä ja yleensä varoittavat potilaita ennen uuden lääkityksen aloittamista, jotta he tietävät, mitä odottaa.
Jotkut ehkäisymenetelmät voivat aiheuttaa kuukautisten pysähtymisen kokonaan. Toiset voivat johtaa kuukautisten lisääntymiseen tai tiputteluun kuukautisten välillä, erityisesti sopeutumisaikana. Naisia, joilla on epäsäännöllisiä kuukautisia ehkäisymenetelmän aikana, voidaan neuvoa pitämään ne useiden kuukausien ajan, jos mahdollista, nähdäkseen, vakautuuko kuukautiset, kun keho on tottunut hormoneihin. Joillekin naisille epäsäännölliset kuukautiset ja syntyvyyden hallinta ovat jatkuva ongelma, ja muita ehkäisymenetelmiä on ehkä tutkittava.
Ehkäisymenetelmien muuttaminen voi johtaa epäsäännöllisyyteen, koska uusi lääkitys voi sisältää erilaisia hormoneja eri annoksina. Vaikka hormonaalista syntyvyyttä pidetään usein vaihdettavissa, on olemassa useita tyyppejä. Naiset, jotka kamppailevat epäsäännöllisten kuukautisten ja syntyvyyden kanssa, saattavat haluta kokeilla eri hormonaalista menetelmää ennen kuin luopuvat hormonaalisesta ehkäisystä kokonaan.
Naisilla, joilla on raskaat kuukautiset ja erittäin epäsäännölliset syklit, joskus hormonaalisen ehkäisyn määrääminen voi säätää kuukautiskiertoa. Jaksot ovat tyypillisesti kevyempiä vakiintuneella hoidolla sen lisäksi, että ne laskevat ennustettavissa olevilla aikaväleillä. Tämä epäsäännöllisten kuukautisten ja syntyvyyden välinen yhteys selittää, miksi lääkärit voivat joskus määrätä hormonaalista ehkäisyä ihmisille, jotka eivät ole seksuaalisesti aktiivisia; Tavoitteena tässä tapauksessa ei ole ehkäisy, vaan kuukautiskierron säätely ja potilaan mukavuuden lisääminen.