Evoluution ja uskonnon välinen yhteys on usein kiistanalainen, ja jotkut uskonnolliset henkilöt haastavat evoluutioteorian uskontonsa loukkaamiseksi. Joillekin sekä evoluutioteoria että uskonnolliset vakaumukset kykenevät helposti rinnakkain ja yksinkertaisesti laajentamaan toisiaan laajemman näkemyksen luomiseksi. Toisille evoluution ja luonnollisen valinnan taustalla olevat ajatukset ovat kuitenkin täysin ristiriidassa heidän uskonnollisten näkemystensä kanssa, ja nämä kaksi ajatusta ovat toisensa poissulkevia. Monet tiedemiehet kuitenkin väittävät, että evoluution ja uskonnon ei tarvitse olla yksinomaisia ajatuksia ja että evoluutio ei missään tapauksessa anna lausuntoa minkäänlaisista jumaluuksista.
Suuri osa konfliktista evoluution ja uskonnon välillä johtuu siitä, että evoluutioteoria haastaa joidenkin uskontojen luomistarinoita. Esimerkiksi juutalais-kristillisissä uskomusjärjestelmissä luomiskertomus tulee Mooseksen kirjasta, joka löytyy sekä kristillisestä että heprealaisesta Raamatusta. Tässä tarinassa sanotaan, että maailmankaikkeus ja kaikki siinä oleva on juutalais-kristillisen Jumalan luoma yhdessä ihmiskunnan ja erilaisten kasvien ja eläinten kanssa tietyllä tavalla. Tämän tarinan kirjaimellinen lukeminen luo ristiriidan evoluution ja uskonnon välillä.
Evoluutioteoria on pohjimmiltaan ajatus siitä, että kaikki elämä maapallolla on peräisin yhteisestä perinnöllisestä lähteestä miljardeja vuosia aiemmin. Tästä lähteestä vuosituhansien aikana on kehittynyt ja kehittynyt lukuisia erilaisia elämänmuotoja kaloista ja linnuista nisäkkäisiin ja matelijoihin. Genesis -luomistarinan kirjaimellinen lukeminen osoittaa kuitenkin, että maailmankaikkeus ja maapallo luotiin vain seitsemässä päivässä ja että kaikki nykyaikaiset elämänmuodot luotiin yhdessä suunnilleen samaan aikaan. Tämä lukeminen on ristiriidassa evoluution kanssa, joten tämä voi usein aiheuttaa ristiriidan evoluution ja uskonnon välillä.
Monet tiedemiehet kuitenkin väittävät tätä konfliktia vastaan ja korostavat ajatusta, että sekä evoluutio että uskonto voivat esiintyä rinnakkain yhdessä maailmankatsomuksessa. Vain kirjaimellinen tulkinta tällaisista luomistarinoista estää suuremman näkemyksen mahdollisuuden. Monille ihmisille on helppo nähdä nämä luomistarinat metaforisina esityksinä maailmankaikkeuden luomisesta ja uskoa, että hyväntahtoinen jumaluus seurasi tai alun perin käynnisti evoluutioprosessin. On myös joitakin uskontoja ja uskomusjärjestelmiä, joissa tämä evoluution ja uskonnon välinen ristiriita ei ole ongelma, ja jotka omaksuvat avoimesti evoluutioteorian ilman ristiriitaa eri uskonnollisten vakaumusten kanssa.