Kymografia on biokemistien suorittama tekniikka, jossa hiukkaset dispergoidaan sähkövarauksella prosessissa, joka tunnetaan elektroforeesina. Erityisesti prosessissa käytetään substraattia, jossa entsyymi reagoi polymeroinnin kautta polykryyliamidigeelin kanssa, joka on vesipohjainen liuos, joka on valmistettu myrkyllisistä materiaaleista. Tämä zymogram-geeli tunnetaan natriumdodekyylisulfaattipolyakryyliamidigeelinä (SDS-PAGE).
Biokemisti, joka suorittaa zymografiaa, valmistaa zymogram -geelin elektroforeesimenetelmää käyttäen. Yleensä tämä menetelmä tehdään yhdessä geelin kiehumisen tai pelkistämisen kanssa. Zymografiassa SDS-PAGE-geeli pidetään kuitenkin ehjänä. Tämän vaiheen jälkeen yhdisteen SDS-osa poistetaan käyttämällä materiaalia, joka tunnetaan nimellä Triton X-100 ™, BASF ™ -yhtiön hapettava pesuaine. Tätä materiaalia pidetään 98 ° F: ssa (noin 37 ° C) pitkään kehittyneessä inkubaattorissa. Biokemikko värjää jäljelle jääneen materiaalin joko mustalla tai sinisellä yhdisteellä. Tämän avulla tutkija voi tunnistaa missä ja miten aineen entsyymit pilkkovat.
Vaikka SDS-PAGE-geeli on yleisimmin käytetty aine symmetografiassa, muuntyyppistä materiaalia voidaan käyttää entsyymin hajoamisnopeuden ja kyvyn tunnistamiseen. Usein tähän sisältyy tärkkelyskalvon lisääminen visuaalisen tunnistamisprosessin helpottamiseksi.
Biokemistit ja biolääketieteen insinöörit käyttävät yleensä tätä prosessia oppiakseen uusia entsyymimuotoja. Määrittelemällä entsyymin hajoamisnopeus ja liikkumismallit voidaan tunnistaa ihmisten ja eläinten proteiinien erilaiset ominaisuudet. Tätä käytetään tiettyihin geneettisiin tutkimuksiin ja analyyseihin sekä lääke- ja lääketieteellisiin sovelluksiin.
Zymografiaprosessia on käsiteltävä varoen. Vaikka se voidaan periaatteessa tehdä minimaalisilla turvatoimenpiteillä, materiaalien käsittelevän tiedemiehen tai tutkijan on vältettävä fyysistä kosketusta. Sekä Triton X-100 ™ -pesuaine että SDS-PAGE-geeli voivat olla erittäin myrkyllisiä iholle.
On olemassa useita entsyymejä, jotka eivät reagoi odotetusti tähän prosessiin. Esimerkiksi D. melanogasterin ruoansulatuskanavan glykosidaasit voivat selviytyä pelkistysprosesseista muuntyyppisissä ruoansulatuskanavan tutkimuksissa. Lisäksi se selviää lämmitysprosessista aina noin 122 ° F: seen (noin 50 ° C), mikä on selvästi yli tavanomaisen symbografisen prosessin tarpeen. Kun entsyymi selviytyy prosessista sulattamatta SDS-PAGE-geeliä kokonaan, kaistan erottelukyky kasvaa viimeisissä vaiheissa. Tämä voi aiheuttaa ongelmia oikean tuloksen saamisessa zymografiaprosessista.