Toimintaperusteinen kustannuslaskenta viittaa menetelmään, jolla tuotantokustannukset kohdistetaan oikealle lähteelle, toisin kuin yleinen kustannusten jakaminen tasapuolisesti eri lähteille valmistusprosessin aikana. Toimintaperusteisen kustannuslaskennan ja toimintaperusteisen hallinnan välinen suhde johtuu siitä, että toimintaperusteiseen hallintaan voi vaikuttaa toimintaperusteisen kustannuslaskentaprosessin analyysin aikana saadut tiedot. Jotta voidaan ymmärtää oikein toimintaperusteisten kustannusten ja toimintoihin perustuvan hallinnan välinen yhteys, on ymmärrettävä, mitä nämä kaksi kirjanpitotermiä tarkoittavat.
Yleensä, kun valmistajat yrittävät laskea valmistajan tuotelinjan eri tuotteiden tuotantokustannukset, he tekevät tämän tarkastelemalla kyseisen tuotteen tuotantoprosessin volyymiä ottamatta huomioon muita tekijöitä, jotka saattavat tehdä tästä tilastosta epätarkan. Esimerkiksi saman yrityksen tuotteen A ja tuotteen B tuotantokustannusten laskentaa voidaan käyttää havainnollistamaan toimintaperusteisen kustannuslaskennan ja toimintaperusteisen hallinnon käsitteitä. Jos oletetaan, että valmistaja tietää jo tuotteen A ja tuotteen B valmistuksesta aiheutuvat suoraan aiheutuvat kustannukset, mutta se yrittää edelleen selvittää näiden kahden tuotteen tuotantokustannuksia, tämä prosessi edellyttää toimintoperusteisen kustannuslaskennan soveltamista jotta voidaan tehdä oikea johtopäätös, koska tällaiset yleiskustannukset voivat olla harhaanjohtavia ilman asianmukaista analyysiä. Tässä tapauksessa sekä tuotteen A että tuotteen B tuotantokustannukset voivat aiheuttaa yleiskustannuksia, kuten raaka -aineiden tarkastus ennen tuotantoa ja ennalta määrätyn määrän työntekijöiden käyttäminen osana tuotantoprosessia.
Jos tuotteen A valmistusprosessi käyttää tuotteen luonteen vuoksi vähemmän tehtaan työntekijöiden panosta, vaikka työntekijät olisivatkin käytettävissä tuotantoprosessiin, tämä toimii tekijänä laskettaessa toimintaperusteista kustannuslaskentaa. Jos tuote B käyttää kaikkia tehtaan käsiä tuotantoprosessin aikana, vaikka tuotettujen tuotteiden määrä olisi pienempi kuin tuotteen A tuotannosta, tämä heijastuu myös laskettaessa toimintoperusteisia kustannuksia vaikuttavana tekijänä, tehdä tuotteesta B kalliimpaa. Toimintaperusteisten kustannusten ja toimintaperusteisen hallinnan välinen yhteys liittyy tapaan, jolla näitä tietoja voidaan käyttää hallitsemaan paremmin valmistusprosessia kustannustehokkuuden parantamiseksi.