Useimmat junat Euroopassa voidaan tyypillisesti jakaa kahteen osaan: matkustaja- ja tavaraliikenne. Näiden kahden haaran sisällä voi olla erilaisia tyyppejä. Junat voidaan myös erottaa paikallis- ja kaukojunista. Kukin Euroopan maa luo yleensä yksityiskohtaisempia luokkia junijärjestelmälle.
Kaukoliikenteen matkustajajunat matkustavat Euroopassa tyypillisesti vähintään tunnin ja joskus useita päiviä kestävillä matkoilla. Monet näistä junista tulevat muihin maihin, mikä tekee niistä suositun kansainvälisen matkustustavan. Eurostar ja EuroCity ovat kahdenlaisia junia Euroopassa, jotka tarjoavat kansainvälisiä kohteita. Jotkin junatyypit voivat liikkua vain kahden maan välillä, kuten Cisalpino AG, joka kulkee Sveitsin ja Italian välillä.
Monet kaukoliikenteen junat Euroopassa ovat myös nukkumisjunia. Nämä junat tarjoavat matkustajille vuoteita ja kulkevat tyypillisesti läpi yön. Jotkut näistä majoitusyksiköistä voivat tarjota yksityisiä huoneita, mutta toisissa eurooppalaisissa makuuvaunuissa on makuuvaunuja. Nämä junat ryhmittävät neljä tai kuusi ihmistä osastoihin, joissa on kerrossängyt yöllä. Päivän aikana sohvaosastoissa on penkki.
Paikalliset matkustajajunat Euroopassa pysyvät yleensä yhden maan rajojen sisällä. Jotkut paikalliset junayhteydet palvelevat vain yhtä kaupunkia, kuten Lontoon metro tai Pariisin metro. Tämäntyyppiset junat voivat tarjota olennaisen palvelun sekä matkailijoille että paikallisille suurissa kaupungeissa, joissa on vilkkaita ja ruuhkaisia katuja.
Jotkut Euroopan junat tarjoavat vierailijoille retkiä, ja tarjolla on aikataulun mukaisia nähtävyyksiä ja aterioita. Näitä junayhteyksiä ovat Golden Eagle, Danube Express ja The Royal Scotsman. Venetsian Simplonilla ajaessaan matkustajat voivat valita yhden perinteisemmistä retkistä tai eurooppalaiseen arkkitehtuuriin keskittyvän ”Arkkitehtonisen juhlan”. Vaikka jotkut kiertojunat tutkivat useita maita, toiset keskittyvät vain yhteen maahan.
Euroopassa junat on joskus jaettu eri luokkiin, toisin kuin lentokoneilla matkustaminen. Ylellisissä junissa tai ensiluokkaisessa matkustavat saavat yleensä aterian matkan aikana ja muita pieniä yksityiskohtia, jotka tekevät matkasta mukavampaa. Toisaalta rahapulaiset matkustajat voivat yleensä löytää halpoja junalippuja budjettimatkalleen. Jotkut kansainväliset junat Euroopassa tarjoavat matkustajille päivittäisiä, viikoittaisia tai kuukausilippuja.
Eurooppalaiset junat ovat myös tehokas työkalu yrityksille, joiden on kuljetettava tuotteitaan koko maassa tai mantereella. Näitä junia kutsutaan tavarajuniksi, ja ne voidaan jakaa kahteen päätyyppiin: yksikköjunat ja karuselli-junat. Yksikköjunilla on yksi lähtökohta ja yksi määränpää, kun taas karuselli-juna saattaa noutaa ja pudottaa tavarat useilla pysäkeillä matkan aikana.