Antibioottien valmistukseen liittyvät menettelyt riippuvat siitä, onko tuote luonnollinen, puolisynteettinen vai täysin synteettinen. Luonnollisia lääkkeitä valmistetaan viljelemällä mikro-organismeja valvotuissa olosuhteissa ja keräämällä niiden ilmentämät yhdisteet, kun taas puolisynteettisiin tuotteisiin liittyy lisävaihe luonnollisesti tuotettujen kemikaalien muokkaamiseksi. Synteettiset aineet, kuten sulfa -lääkkeet, valmistetaan kemiallisella valmistusprosessilla. Antibioottien tuotanto vaatii kaikissa tapauksissa steriiliä ympäristöä, jota on jatkuvasti seurattava, jotta voidaan tarkistaa kontaminaation merkit, jotka voivat häiritä lääkkeiden turvallista tuotantoa.
Luonnolliset antibiootit edellyttävät mikro -organismiviljelmän valmistamista, kuten sieniä, jotka ilmentävät antibiootteja sivutuotteena. Niitä kasvatetaan suurissa käymisäiliöissä ruoan kanssa, jotta ne lisääntyvät. Mikrobiologi valvoo prosessia, hallitsee lämpötilaa, kosteutta ja muita olosuhteita sadon lisäämiseksi. Antibioottiliemen valmistaminen voi kestää useita päiviä, ja se on ajettava suodatusjärjestelmien läpi lääkkeen puhdistamiseksi ja uuttamiseksi. Testaus varmistaa henkilöstölle, että antibioottien tuotanto ei ole saastunut ja että lääkitys on riittävän vahva myytäväksi yleisölle.
Puolisynteettiset huumeet lisäävät tähän askeleen. Luonnontuotteen puhdistamisen ja pakkaamisen sijaan tuotantolaitoksen henkilökunta käsittelee sitä kemiallisella prosessilla. Tämä vaihe antibioottien valmistuksessa muuttaa lääkkeen rakennetta. Se ei ole täysin synteettinen, koska se perustuu luonnontuotteeseen, mutta se ei ole sama tuote kuin mitä luonnosta löytyy. Nämä lääkkeet voivat olla virulenttisempia useampia organismeja vastaan tai niillä voi olla vähemmän sivuvaikutuksia kuin niiden luonnollisessa muodossa. Ampisilliini on esimerkki puolisynteettisestä antibiootista.
Synteettiset lääkkeet valmistetaan kemiallisilla reaktioilla, alkaen raaka -aineesta, jota muutetaan kontrolloidussa ympäristössä. Antibioottien tuotantoa synteettisillä prosesseilla voi olla helpompi valvoa, koska se ei ole fermentointisäiliöissä käytettävien elävien organismien luonnollisten vaihtelujen alainen. Se vaatii edelleen huolellista seurantaa kontaminaation tarkistamiseksi ja puhtaiden ja standardipitoisten lääkkeiden tuottamiseksi.
Kuten muidenkin lääkkeiden kohdalla, antibioottien tuotantoa säätelee hallitus. Virastot voivat tarkastaa tuotantolaitokset ja tuote -erät, joilla on valta saada lääkkeet takaisin, jos on huolta turvallisuudesta tai tehosta. He voivat myös pyytää testaus- ja laadunvalvontamenettelyjä dokumentoivia lokeja varmistaakseen, että yrityksellä on selkeät sisäiset standardit ja että ne noudattavat niitä koko ajan.