Selvityskeskusrahastot ovat keskuspankkien kautta kulkevia resursseja. Lähetysväline on tavallisesti henkilökohtainen shekki yksittäiseltä asiakkaalta tai yrityssekki yritykseltä, joka on joko selvityskeskuksen suora asiakas tai selvitysjäsen. Selvityskeskusrahastojen päätehtävä on varmistaa varojen vastaanotto tavalla, joka on dokumentoitu vastaanottopisteestä aina varojen käyttöönoton kautta.
Selvityskeskusvarojen käsittelykaava on suhteellisen yksinkertainen. Kaikki tapahtumat kulkevat niin kutsutun keskuskäsittelymekanismin läpi. Mekanismi sisältää komponentteja, jotka auttavat kirjaamaan sekin vastaanottamisen, tekemään alustavan hakemuksen asiakkaan tilisaldolle ja pitämään varat kesken, kunnes sekki tyhjentää maksun suorittaneen pankin. Kun sekki on selvitetty, selvityskeskus kirjaa varat asiakkaan tilille ja voi käyttää saldoa asiakkaan tilausten täyttämiseen.
Selvityskeskusvarojen käsittelyprosessi vaihtelee pankkien lukumäärän ja sekkiin liittyvän todentamisen nopeuden perusteella. Kun selvityskeskus ja asiakas käyttävät samaa pankkilaitosta, selvityslaitoksen varat voivat olla käytettävissä yhden työpäivän kuluessa. Jos kuitenkin mukana on useampi kuin yksi pankki, koko prosessi voi kestää kahdesta viiteen arkipäivää.
Asiakkaan ja selvityskeskuksen välisestä suhteesta riippuen toimeksiannot voidaan toteuttaa odottamatta selvityslaitoksen varojen lähettämistä. Näin voi olla, jos selvityskeskuksen menettelyt mahdollistavat lyhytaikaisen luoton myöntämisen asiakkaille, jotka täyttävät tietyt taloudelliset kriteerit. Luoton myöntäminen on etuoikeus, joka tarkistetaan aika ajoin, ja se voidaan peruuttaa, jos asiakkaan sekki ei tyhjene varojen riittämättömyyden vuoksi.