Eläinlääketieteellinen epidemiologi seuraa eläinpopulaatioita ihmisten ja eläinten terveyden suojelemiseksi. Työhön voi kuulua vastaaminen tautipesäkkeisiin, osallistuminen kliinisiin tutkimuksiin ja työskentely kansanterveysviranomaisten kanssa. Tämän alan ihmisiä voidaan työllistää valtion virastoissa sekä lääkeyhtiöissä ja eläinten hyvinvointijärjestöissä. Monilla alueilla on välttämätöntä, että hänellä on lisensoitu eläinlääkäri, jolla on kliinistä kokemusta työskennellä epidemiologina, ja jotkut työnantajat pitävät parempana työnhakijoita, joilla on erityistä kokemusta ja koulutusta epidemiologian alalla.
Eläinten terveys ja hyvinvointi ovat huolestuttavia useista syistä. Eläinpopulaatioiden taudit voivat hypätä ihmisiin, olivatpa ne sitten lintujen influenssaviruksia tai lääkeresistenttejä bakteeri -infektioita elintarvikkeissa. Eläinpopulaatioiden huonolla terveydellä voi olla myös taloudellisia vaikutuksia. esimerkiksi jos ruokaeläinten populaatio on tuhottava suu- ja sorkkataudin puhkeamisen vuoksi. Eläinlääketieteellinen epidemiologi pyrkii suojelemaan ihmisten ja eläinten etuja keskittyen taudin puhkeamisen rajoittamiseen ja sen hallintaan sen esiintyessä.
Tietyt eläintaudit voidaan ilmoittaa pakollisesti, jolloin viljelijöiden, eläinlääkäreiden ja muiden sairaiden eläinten kanssa kosketuksiin joutuvien on tehtävä ilmoitus eläinlääkintäepidemiologille. Nämä terveydenhuollon ammattilaiset seuraavat raportteja, reagoivat tautitapauksiin ja hallitsevat tutkimuksia. Jos tiedossa oleva tauti puhkeaa, eläinlääketieteellinen epidemiologi voi hallinnoida vastaussuunnitelmaa sen hallitsemiseksi. Tuntemattomien sairauksien vuoksi työ voi vaatia salausta selvittääkseen mitä tapahtuu ja kehittää tapa hallita sitä.
Eläinlääketieteelliset epidemiologit voivat tarjota julkista tiedotusta ja koulutusta erityisesti eläinten kanssa työskenteleville. He voivat keskustella tavallisista sairauksista, tavoista estää niitä ja kuinka tunnistaa ne, kun niitä esiintyy eläinpopulaatioissa. Tämä voi aiheuttaa erityistä huolta kuljetettavista ja myydyistä eläimistä, kuten lihaeläimistä, jotka voidaan lähettää kaukaisiin ruokintapaikkoihin, tai tutkimuksessa käytettävistä eläimistä, jotka voidaan tuoda maan ulkopuolelta. Tartunnan saaneet he voivat levittää taudin uusille populaatioille ja aiheuttaa kansanterveyskriisin.
Toinen osa työtä voi keskittyä sairaiden eläinten hoitojen kehittämiseen. Kliinisissä tutkimuksissa voi olla mukana eläinlääketieteellinen epidemiologi, ja seuranta voi tapahtua sen jälkeen, kun lääkkeet on hyväksytty myytäväksi. Jos haittavaikutuksia, epätavallisia lääkkeiden yhteisvaikutuksia tai muita ongelmia alkaa esiintyä, lääke voidaan tarkistaa, jotta voidaan selvittää, tarvitseeko se lisävaroituksia vai onko se poistettava markkinoilta.