Saatavilla on melko vähän erityyppisiä MP4 -muokkausohjelmia, ja nämä ohjelmat keskittyvät usein tiettyihin tiedostotyyppeihin, ja niitä löytyy monenlaisista hinnoista. Jotkut ohjelmat on suunniteltu äänitiedostojen muokkaamiseen, ja niissä on useita erilaisia ominaisuuksia tähän tarkoitukseen. Muut MP4 -muokkausohjelmistot on luotu käytettäväksi MP4 -videotiedostojen muokkaamiseen. Nämä ohjelmat sisältävät usein useita erilaisia apuohjelmia ja vaihtoehtoja, kuten yhden videon jakamisen useisiin osiin ja yhden videon kokoamisen useista erillisistä videoista.
MP4 -muokkausohjelmisto on ohjelma, joka on suunniteltu ja kehitetty auttamaan jotakuta muokkaamaan yhtä tai useampaa MP4 -tiedostoa. MP4-tiedosto on erityinen tiedostotyyppi medialle, jota kutsutaan teknisesti nimellä MPEG-4 tai MPEG-4 Part 14, joka voi sisältää myös ääntä, videota ja muita metatietoja. Tämäntyyppisiä tiedostoja käytetään usein äänen ja videon suoratoistoon, vaikka vain äänelle käytetyt tiedostot muunnetaan usein M4A- tai MPEG-4-äänitiedostoiksi. MP4 -muokkausohjelmistoa voidaan käyttää MP4 -tiedostojen muokkaamiseen useilla eri tavoilla, ja saatavilla on sekä kaupallisia tuotteita, jotka voivat olla melko kalliita, että ladattavia ilmaisohjelmia.
Yksi yleisimmistä MP4 -muokkausohjelmistoista on ohjelma, joka on erityisesti suunniteltu käytettäväksi äänitiedostojen muokkaamiseen. Näiden ohjelmien avulla editori voi usein muuntaa eri tiedostotyyppejä, yleensä liittyviä tiedostotyyppejä, kuten MP3 ja M4A, ja pakata tiedostoja helpottaakseen suoratoistoa Internetissä. Tämän tyyppinen ohjelma sallii usein myös editorin yhdistää useita ääniraitoja yhdeksi pidemmäksi kappaleeksi, jakaa pitkän kappaleen pienemmiksi paloiksi ja kerrostaa äänitiedostoja yhdessä. MP4 -muokkausohjelmisto voi myös sallia editorin sisällyttää metatiedot tiedostoon, kuten raidan otsikkoon, tallenteen esittäjään ja asettaa suojausasetukset lisensointia varten.
MP4 -muokkausohjelmisto voidaan myös kehittää erityisesti käytettäväksi videotiedostojen tai sekä ääntä että videota sisältävien multimediatiedostojen muokkaamiseen. Nämä ohjelmat sallivat yleensä editorin yhdistää useita videotiedostoja tai jakaa videotiedoston erillisiksi tiedostoiksi. Editoija pystyy usein käsittelemään myös ääniraidan videoraidalla, yleensä videosta eristettynä, jolloin editori voi muuttaa ääntä tai lisätä uutta ääntä videoon. MP4 -muokkausohjelmistoa käyttävä editori voi myös tyypillisesti viedä lopullisen videon pakattuun muotoon suoratoistoa varten, lisätä metatietoja ja muuttaa viedyn tai tallennetun videotiedoston lopullista resoluutiota.