Sikainfluenssa ja kausi -influenssa voivat esiintyä rinnakkain influenssakauden aikana, mutta niiden välillä on useita eroja siitä, miten virus leviää, kuinka kauan se tuntuu tartunnan saaneissa; Myös immuunijärjestelmä reagoi niihin. Ehkä tärkein ero on se, että kausi -influenssa voidaan laskea tarttumaan väestöön suhteellisen säännöllisesti, mutta ei ole mitään keinoa tietää milloin, missä tai kuinka paha sikainfluenssa tulee olemaan.
Yksi influenssavaihtoehto voidaan laskea vuosittain ympäri väestöä. Alueesta riippuen kausi -influenssaa esiintyy jonkin verran säännöllisesti; tämä ennustettavuus antaa yksilöille aikaa rokotukseksi ennaltaehkäisevänä toimenpiteenä. Kun sikainfluenssa muuttui yhtäkkiä hyppäämään sioista ihmisiin, terveysjärjestöt eivät olleet suurelta osin valmistautuneet siihen, koska taudinpurkausta ei ollut mahdollista ennustaa.
Koska kausiluonteinen influenssa on niin laajalle levinnyt, ihmiskeho on pystynyt kehittämään joitakin vasta -aineita infektion torjumiseksi. Tämä immuniteetti ei ole täydellinen, ja yksilöille kehittyy yleensä muutaman päivän oireita; Sikainfluenssaan sairastuneet altistuvat kuitenkin virukselle, jota ei ole koskaan ollut ihmispopulaatiossa. Koska se on uusi sairaus, sille ei ole luonnollista vastustuskykyä, ja ihmiset ovat erittäin alttiita kaikille oireille.
Sikainfluenssan ja kausi -influenssan oireet ovat samankaltaisia ja koostuvat samoista ruumiinsärkyistä, kuumeesta, yskästä ja kurkkukipuista. Sikainfluenssassa nämä oireet ovat kuitenkin heikentäviä; kestää pidempään; ja voi yleisemmin sisältää ruoansulatuskanavan häiriöitä, kuten pahoinvointia, ripulia ja oksentelua. Lapset ovat alttiimpia kärsimään komplikaatioista molemmista influenssatyypeistä, kun taas vanhukset ovat itse asiassa vähemmän alttiita tarttumaan vakaviin sikainfluenssatapauksiin.
Sikainfluenssan ja kausi -influenssan alkuperä on myös erilainen. Kausi -influenssaa aiheuttava virus on ihminen, mikä tarkoittaa, että se kiertää pääasiassa ihmisväestön kautta. Sikainfluenssa kehittyy sioille, kun yksittäinen eläin sairastuu useampaan kuin yhteen influenssatyyppiin, kuten sikainfluenssaan ja ihmisen influenssavirukseen. Kun näitä viruksia esiintyy samassa eläimessä samanaikaisesti, ne voivat käydä läpi mutaation, jonka ansiosta ne voivat levitä kummankin lajin läpi. Koska sikainfluenssalla ja kausi -influenssalla on niin erilainen alkuperä, on olemassa erilaisia rokotuksia jokaisen influenssatyypin torjumiseksi.