Termit “toimitusketju” ja “logistiikka” ovat usein käytettyjä keskenään kuljetusalalla. Ne ovat kuitenkin erillisiä alueita, joista jokaisessa on tiettyjä prosesseja, velvollisuuksia ja vastuita. Sekaannus toimitusketjun ja logistiikan erottamisessa toisistaan voi johtua siitä, että monet pitävät logistiikkaa toimitusketjun hallinnan alaluokana. Suurin ero toimitusketjun ja logistiikan välillä on se, että logistiikka on vain erikoistunut osa koko toimitusketjun prosessia.
Yleensä logistiikka keskittyy tavaroiden todelliseen kuljetukseen ja varastointiin. Se käsittelee asioita, kuten saapuva ja lähtevä rahti, käänteinen toimitus, viestintä kauttakulun aikana, varastointi ja varastointi. Logistiikka käsittelee myös tavaroiden ja rahdin toimittamista, koordinointia kolmansien osapuolten kuljettajien välillä, kaluston hallintaa ja muuta toimintaa, joka liittyy suoraan tavaroiden todelliseen kuljetukseen pisteestä toiseen. Tietyn yrityksen tarpeista riippuen logistiikan hallinta voi käsittää myös valmistuksen ja pakkaamisen, hintaneuvottelut kuljetuksen eri osa-alueista, kolmannen osapuolen integraation ja hankinnan, tekniikan, viestinnän ja asiakaspalvelun.
Suurimmassa osassa toimitusketju kattaa suuremman kuvan. Toimitusketjun hallinta on katto, joka kattaa kaikki tavaroiden hankinnan ja hankinnan näkökohdat. Pohjimmiltaan toimitusketjun hallinta muodostaa ja hallinnoi yritysten välisiä yhteyksiä, jotka mahdollistavat tavaroiden lopullisen myynnin kuluttajille. Logistiikka, periaatteessa rahdin kuljettaminen paikasta toiseen, on tehtävä, joka kuuluu toimitusketjun hallinnan laajaan kattoon, mutta on vain yksi osa koko prosessia.
Toimitusketjun hallinta on laaja, integroiva prosessi, joka sisältää monia muita näkökohtia logistiikan lisäksi. Näitä näkökohtia ovat tavaroiden löytäminen ja hankkiminen myytäväksi, neuvottelu hinnoittelusta, valmistuksesta, varastoinnista, pakkaamisesta ja varastonvalvonnasta. Toimitusketjun hallintaan kuuluu myös jakelu, kustannusten kohdentaminen ja valvonta, kolmansien osapuolten neuvottelut ja yhteistyö sekä tarjonnan ja kysynnän hallinta. Toimitusketjun hallinnan kattama laaja alue on syy, miksi jotkut näistä prosesseista ovat jakautuneet toiseen toimitusketjun hallinnan alaluokkaan, joka tunnetaan kysynnän suunnitteluna ja jota logistiikan tavoin voidaan pitää erillisenä mutta siihen liittyvänä osaamisalueena.
Sekä toimitusketjun että logistiikan yksityiskohdat ja täsmälliset määritelmät vaihtelevat yrityksittäin ja ovat jossain määrin päällekkäisiä. Tarvittaessa monet logistiikan hallintaan liittyvistä tehtävistä ja vastuista siirtyvät toimitusketjun hallintaan ja päinvastoin. Tietyn yrityksen koosta ja erikoistumisesta riippuen nämä kaksi aluetta voidaan yhdistää yhteen, ja sama henkilö voi hoitaa sekä toimitusketjua että logistiikkaa. Jokaisen henkilön, joka haluaa osallistua joko toimitusketjun hallintaan tai logistiikan hallintaan yrityksen sisällä, on varmistettava, että hänen vastuunsa parametrit on määritelty selkeästi.