Antibakteerisilla tuotteilla on taipumus vähentää lievempien bakteerien kasvua, kun taas antimikrobiset tuotteet estävät laajemman bakteerivalikoiman, mukaan lukien homeet, kasvun. Vaikka antibakteeriset ja antimikrobiset tuotteet ovat molemmat yleisiä, antimikrobiset ominaisuudet näkyvät todennäköisemmin reseptilääkkeissä. Kemikaaleja, joita käytetään pintabakteerien vähentämiseen ja tappamiseen, löytyy todennäköisesti käsikaupasta saatavista antibakteerisista käsienpesu- ja kasvotuotteista. Toisin kuin mikrobilääkkeet, ne eivät estä bakteerien kasvua tai esiintymistä.
Ensisijainen ero antibakteeristen ja antimikrobisten kemikaalien välillä on niiden kyky estää bakteerien kehittyminen. Esimerkiksi antibakteeriset saippuat tappavat yleensä lieviä tai kohtalaisia bakteerikantoja, jotka voivat joutua kosketuksiin ihon pinnan kanssa. Toisaalta mikrobilääkkeiden on osoitettu estävän bakteerien leviämistä, jotka voivat elää ja lisääntyä ihmiskehossa. Jotkut tämän tyyppisistä bakteereista voivat edistää sairauksien ja häiriöiden, kuten tulehduksellisen aknen, kehittymistä.
Sekä antibakteerisia että antimikrobisia tuotteita voidaan käyttää vastustamaan bakteereja, vaikka ne on yleensä suunniteltu kestämään erilaisia bakteerikantoja. Antimikrobisia kemikaaleja käytetään yleensä reseptilääkkeiden kehittämiseen, kemoterapiahoitoihin ja sienilääkkeisiin. Sitä vastoin yksi antibakteeristen aineiden pääasiallisista käyttötarkoituksista on estää bakteerien leviäminen, jotka voivat kehittyä tavalliseksi kylmäksi tai aiheuttaa pinta -ihotulehduksia. Kloorivalkaisu on esimerkki tuotteesta, joka sisältää antibakteerisia ominaisuuksia, ja sitä käytetään usein keittiössä ja kylpyhuoneessa esiintyvien pintabakteerien määrän vähentämiseen.
Yksi tärkeistä eroista antibakteeristen ja antimikrobisten tuotteiden välillä on se, että mikrobilääkkeillä on tapana estää bakteerien leviämistä. Esimerkiksi mikrobilääkkeiden on osoitettu estävän homeen kasvua, joka pyrkii lisääntymään ja leviämään nopeasti. Vaikka antibakteeriset tuotteet voivat tappaa olemassa olevia bakteereja, niitä on jatkuvasti levitettävä uudelleen tai käytettävä uudelleen pysyvien kantojen poistamiseksi. Mikrobilääkkeillä ei ole tapana ainoastaan tappaa olemassa olevia bakteereja, vaan ne estävät kantojen lisääntymisen ja leviämisen muille alueille.
Antibakteeristen ja antimikrobisten valmisteiden toistuva käyttö voi saada ihmisen vastustamaan omaa kykyään torjua infektioita. Tämä näyttää olevan enemmän huolestuttavaa tietyntyyppisten antibioottien kanssa, joita käytetään lievien tai kohtalaisten infektioiden hoitoon. Resistanssi voi olla ongelma myös miedoissa antibakteerisissa kemikaaleissa, joita käytetään käsin ostettavissa kasvojen ja käsien pesussa. Tietyt antimikrobiset kemikaalit, kuten penisilliini, ovat kestäneet bakteerien kykyä kehittää resistenttejä kantoja.