FSH: ta tai follikkelia stimuloivaa hormonia tuottavat solut, jotka tunnetaan nimellä gonadotrofit, jotka sijaitsevat aivolisäkkeessä aivojen juuressa. Aivolisäke erittää FSH: ta vasteena GnRH -nimiselle hormonille tai gonadotropiinia vapauttavalle hormonille. GnRH vapautuu aivojen toisesta osasta, nimeltään hypotalamus, ja kulkee veressä aivolisäkkeeseen. FSH: n erittymisen jälkeen se stimuloi kivekset tai munasarjat tuottamaan sukupuolihormoneja. Negatiivisessa palautesilmukassa sukupuolihormonien esiintyminen veressä aiheuttaa GnRH -erityksen vähenemistä hypotalamuksesta ja estää aivolisäkkeen gonadotrofeja tuottamasta FSH: ta, minkä seurauksena FSH -tuotanto laskee.
Yhdessä toisen aivolisäkkeen erittämän hormonin kanssa, joka tunnetaan nimellä luteinisoiva hormoni tai LH, follikkelia stimuloiva hormoni on nimeltään gonadotropiini. Gonadotropiineina sekä LH että FSH vaikuttavat sukurauhasiin, jotka ovat munasarjat ja kivekset. Naisilla FSH vaikuttaa munasolujen follikkelien kypsymiseen, joissa munasolut kehittyvät, ja miehillä FSH auttaa siittiöiden tuotannossa. Sekä FSH että LH valmistetaan aivolisäkkeen gonadotrofisolujen sisällä, ja kumpikin koostuu alfa -alayksiköstä ja beeta -alayksiköstä. Vaikka alfa -alayksiköt ovat samat molemmissa hormoneissa, beeta -alayksiköt, jotka sitoutuvat tiettyihin reseptoreihin, ovat erilaisia.
Yhden kuukautiskierron loppua ja seuraavan alkua kohden ovulaation jälkeen jäljelle jäänyt follikkeli, joka tunnetaan keltarauhana, rappeutuu ja sen sukupuolihormonien estrogeenin ja progesteronin tuotanto vähenee. Tämä sukupuolihormonitasojen lasku stimuloi hypotalamusta erittämään enemmän GnRH: ta, ja GnRH: n nousu saa aivolisäkkeen lisäämään FSH -tuotantoaan. FSH vaikuttaa sitten munasarjojen follikkeliin niin, että ne kasvavat ja kypsyvät valmiiksi seuraavaa sykliä varten. Miehillä se auttaa ylläpitämään Sertoli -soluja, jotka ovat välttämättömiä siittiöiden kehittymiselle.
Naisilla kuukautiskierron verenvuodon jälkeen FSH -tuotanto kasvaa edelleen ja munarakkulat kasvavat edelleen. Aluksi ne tuottavat vain pieniä määriä sukupuolihormoneja, mutta lopulta tasot nousevat ja negatiivinen takaisinkytkentävaikutus alkaa. Aivolisäkkeen FSH -tuotanto vähenee vastaavasti, mutta hallitseva follikkeli, joka joutuu ovulaatioon, kehittyy edelleen ja erittää estrogeenia. Ilman progesteronia estrogeenillä on positiivinen palautevaikutus GnRH: hon, ja pitoisuudet nousevat huippuun ovulaation aikaan, jolloin vastaava huippu on FSH: n erityksessä. Kun ovulaatio on tapahtunut, sekä progesteroni että estrogeeni erittyvät ja niiden tasot nousevat, kunnes negatiivinen palaute laukeaa, GnRH -vapautuminen vähenee ja LH- ja FSH -tuotanto vähenee jälleen.