Vuonna 2006 Yhdysvaltain elintarvike- ja lääkevirasto (FDA) julkaisi asiakirjoja, joissa ehdotettiin, että kloonattuja eläimiä ja kloonattuja eläintuotteita päästettäisiin amerikkalaiseen elintarviketuotantoon. Tuloksena oli kansalaisten massiivinen protestointi ympäri maailmaa, jotka herättivät vakavaa huolta ajatuksesta kloonatuista eläimistä ruoassaan. Tämä julkinen kommentti heijasti vastausta geneettisesti muunnettuihin organismeihin ja muihin paljastuksiin amerikkalaisesta viljelystä, kuten altistuminen keskittyneille eläinten ruokintatoimille ja rutiininomainen käytäntö ruokkia eläimiä muille eläimille, tilanne, joka voi mahdollisesti aiheuttaa naudan spongiformista enkefaliittia tai hullua lehmää sairaus.
FDA on väittänyt, että kloonatut eläintuotteet ovat turvallisia kulutukseen, ja on tehnyt lukuisia tutkimuksia klooneista ja niiden tuotteista tämän väitteen tueksi. Itse asiassa jotkut amerikkalaiset ovat jo syöneet kloonatuista eläimistä peräisin olevia tuotteita ilman ilmeisiä haittavaikutuksia. FDA analysoi kloonattujen eläintuotteiden rakenteen ja sisällön ja vertasi sitä perinteisesti lisääntymiskykyisiin eläimiin, eikä havainnut tilastollista eroa näiden kahden välillä.
Kuluttajien kannalta kloonatuista eläimistä käytävässä keskustelussa on useita asioita. Ensimmäinen on kysymys siitä, ovatko kloonatut kudokset ja eläintuotteet todella turvallisia. Toinen on se, että monet kloonit ovat myös geneettisesti muunnettuja, ja FDA on sanonut, että muuntogeeninen eläinmateriaali on vaarallista ihmisravinnoksi. Kolmas on valintakysymys: ovatko kloonattu liha ja eläintuotteet turvallisia vai eivät, kuluttajat haluavat voida valita, mitä he laittavat kehoonsa.
Ensimmäinen huoli kloonatuista eläimistä kumoaa suurelta osin kloonin tuottamisen kustannukset. Mikä tekniikka voi tulla halvemmaksi, kloonin tekeminen on työlästä ja erittäin kallista: lehmien lisääntyminen normaalisti on edelleen halvempaa. Klooneja käytetään jalostuskarjan parantamiseen: esimerkiksi kloonaamalla erityisen täydellinen härkä, maanviljelijä voi lisätä siemennesteen tuottoa vasikoiden tuottamiseksi tai myymiseksi muille lehmänviljelijöille. Nämä kloonit elävät hemmoteltua elämää, koska ne ovat erittäin arvokkaita eläimiä, vaikka biologit ovatkin esittäneet huolta lajien monimuotoisuudesta: kloonatut eläimet vähentävät monimuotoisuutta, varsinkin jos yhtä kloonia käytetään mahdollisesti satojen jälkeläisten tuottamiseen.
Toinen huolenaihe, joka koskee kloonattujen eläinten geneettistä muuntamista, on ongelmallisempi. Voi olla hyvin vaikeaa eristää geneettisesti muunnettuja eläimiä normaaleista eläimistä tai niiden kloonatuista sukulaisista, vaikkakin koska eläinten lisääntyminen on havaittavampaa kuin kasvien, “ristipölytystä” voi olla helpompi välttää. Luontoon pakeneva geneettisesti muunnettu lohi on kuitenkin aiheuttanut vakavia ongelmia luonnonvaraiselle lohelle, koska geneettisesti muunnetut kalat voivat edelleen kasvattaa ja laimentaa luonnonvaraista geenipoolia. Geneettisesti muunnettujen kloonattujen eläinten tarkoitus on epäselvä, koska FDA ei ole ilmoittanut aikovansa päästää tuotteitaan markkinoille terveysongelmien vuoksi, mutta terveiden eläinten geneettisen korruption riski on edelleen olemassa.
Lopuksi valintakysymys on suuri. Monet eläinten oikeuksien aktivistit ovat ottaneet esiin kysymyksiä siitä, miten inhimillisesti kloonattuja eläimiä kohdellaan, koska ne näyttävät olevan vain yhden askeleen päässä tavanomaisesti tuotetuista eläimistä. Yksilöt, jotka ovat huolissaan eläinten oikeuksista, ovat huolissaan myös kloonien oikeuksista, koska kloonattuina tai ei, eläimillä on edelleen ajatuksia, tunteita ja haluja. Muut kuluttajat yrittävät yksinkertaisesti syödä enemmän luonnollista tai terveellistä ruokaa ja epäilevät kloonattujen eläinten kulutusta. Jos FDA ei aseta ja valvo merkintöjä koskevia lakeja, ihmiset eivät ehkä voi tehdä tietoisia valintoja ruoastaan. Ruoka -aktivistit ovat varoittaneet, että kloonien jäljittäminen voi olla erittäin vaikeaa, eikä lihan merkitseminen täsmällisesti voi olla mahdollista, kun kloonatut eläimet tulevat elintarvikkeisiin. Luomuviljelijät ryhtyvät jo toimiin kantojensa suojelemiseksi, mutta tästä voi tulla vaikeaa, kun kloonattujen eläinten jälkeläisten useita sukupolvia on saatavilla avoimilla markkinoilla.