Erilaisia juustoja löytyy kaikkialta maailmasta, joten reseptit ja valmistusmenetelmät vaihtelevat suuresti. Huolimatta juustojen, reseptien ja menetelmien moninaisuudesta, juustonvalmistusprosessiin liittyy yleensä useita perusvaiheita. Maitoon lisätään aloitusviljelmiä ja juoksetta juoksutusprosessin aloittamiseksi, mistä seuraa juustoa ja heraa. Juustoa ja heraa käsitellään edelleen ja sitten suolataan, muotoillaan ja kypsytetään juuston valmistamiseksi.
Ensimmäinen juustonvalmistusprosessi sisältää viljelmien ja juoksutteen lisäämisen maitoon. Sekä maidon että viljelmien tyyppi voi vaihdella juustosta toiseen. Aloitusviljelmät ovat bakteereja, joita käytetään erilaisten makujen tuottamiseen juustossa. Viljelmät aloittavat myös prosessin, jossa laktoosi muutetaan maitohapoksi, joka tunnetaan yleisesti happamoitumisena. Entsyymi, joka tunnetaan myös nimellä, voidaan lisätä prosessin lisäapuun.
Happamoitumisprosessin jälkeen alkuperäisestä maidosta muodostuu juustoa ja heraa. Juustojuusto tuottaa juustoa, kun juuston valmistusprosessi on valmis. Juustotyypistä riippuen juustoa voidaan leikata, cheddared tai keittää. Juustojen leikkaaminen antaa niistä enemmän kosteutta, jolloin juusto on kovempaa. Cheddaring tehdään pieniksi juustoiksi, jotka muodostuvat muotteihin, ja juustojen keittäminen kuumentaa niitä, jolloin saadaan pehmeämpi juusto.
Suolaaminen saa aikaan kaksi asiaa juustonvalmistusprosessissa: juuston maustaminen ja juuston säilyttäminen vanhenemisprosessin aikana. Juustojen maut ovat peräisin useista eri lähteistä, joista yksi on juustovalmistusprosessin aikana juustoon lisättävä suola. Jotta juusto säilyisi kypsymisprosessin aikana, suolaa voidaan hieroa muodostetun juuston päälle tai suolavedessä upotettua rättiä voidaan hieroa juuston päälle.
Juuston muotoiluun kuuluu juustoraasteiden kaataminen eri muotoihin juuston muodon muodostamiseksi. Joillekin juustolajeille käytetään erityisiä muotteja. Kypsyminen on yleensä juustonvalmistusprosessin viimeinen vaihe. Tässä vaiheessa juuston annetaan kypsyä ihanteellisissa olosuhteissa. Alue, jolla juusto kypsytetään, valvoo pitämään lämpötila ja kosteus optimaalisella tasolla. Joidenkin juustojen kypsymisprosessissa toteutetaan lisävaiheita, kuten ruiskutetaan hometta ilmaan, asetetaan muotti juustoon tai sen ympärille tai pestään juusto tietyillä liuoksilla.