Se, mitä tapahtuu lasten hyväksikäyttöä koskevan tutkinnan aikana, ainakin tietyin ehdoin, vaihtelee suuresti lainkäyttöalueiden välillä. Tapahtumat, jotka muodostavat lasten hyväksikäyttöä koskevan tutkimuksen Yhdysvalloissa, poikkeavat Kanadassa, Australiassa, Ranskassa tai Espanjassa tapahtuvista tapahtumista. Samoin paikallisten kuntien väliset tutkintamenettelyt vaihtelevat valtion tai paikallisen lainsäädännön, virastojen politiikan ja muiden tekijöiden mukaan. Vaikka erityispiirteet voivat vaihdella, perusperiaatteet ovat samat. Lasten hyväksikäyttöä koskeva tutkimus sisältää yleensä faktojen keräämisen raportoidusta väärinkäytöksestä, sukututkimuksista, asianomaisten aikuisten oikeus- tai rikoshistoriasta, lääketieteellisistä tiedoista ja historioista sekä henkilökohtaisista haastatteluista, psykologisista arvioista ja turvallisuusmäärityksistä.
Riippumatta paikallisista laeista, joita sovelletaan epäiltyyn lasten hyväksikäyttötapaukseen, koulutetut ammattilaiset aloittavat yleensä dokumentoinnin, joka liittyy ilmoitettuun tapaukseen. Esimerkiksi tapaustyöntekijä voi tarkastella sairaanhoitokortteja päivystyksestä tai poliisin raportteja perheväkivallan puheluista. Toinen vaihe sisältää tyypillisesti henkilökohtaiset haastattelut vanhempien, hoitajien, lääketieteen tai koulun ammattilaisten sekä lapsen ja hänen sisarustensa kanssa. Haastattelija etsii usein väkivallan uhriksi epäiltyjen uhrien haastatteluissa merkkejä lasten hyväksikäytöstä, olivatpa ne sitten fyysisiä, henkisiä tai seksuaalisia, ja ottaa valokuvia kyseenalaisista vammoista tai tunnistaa väärinkäytön merkit. Tarkastelemalla asiakirjoja ja suorittamalla ensimmäiset haastattelut tapaustyöntekijä tai lainvalvontaviranomainen voi määrittää seuraavat vaiheet tutkintaprosessissa.
Joillakin kunnilla on lakeja, jotka säätelevät, mitä lapsen hyväksikäyttöä koskevan tutkinnan aikana tulee tapahtua. Tällaisissa tapauksissa vastuullisten osapuolten on usein suoritettava tietyt vaiheet tietyssä järjestyksessä tai ennalta määrättyjen kriteerien perusteella. Muut kunnat jättävät lapsen hyväksikäyttöä koskevan tutkintamenettelyn tutkinnan suorittavan viraston edustajan harkinnan mukaan. Yhdysvalloissa lasten hyväksikäytön tutkinnan tarkka eteneminen ei ole pakollista. Asiantuntijoille annetaan pikemminkin tietty aika, jonka kuluessa heidän on suoritettava tutkimus ja tehtävä päätös lapsen tarpeista.
Esimerkiksi Yhdysvaltain henkilöstöministeriön, perhe- ja lapsipalvelujen osaston (DFCS) valvontaviraston mukaan, määräykset edellyttävät, että kun kansalainen ilmoittaa lasten hyväksikäytöstä asianomaisille virastoille, DFCS: llä on 24 tuntia aikaa aloittaa muodollinen tutkimus. Lasten hyväksikäyttöä koskevan tutkimuksen on oltava valmis 30 päivän kuluessa ja annettava suositus lapsen hyvinvoinnista ja turvallisuudesta. 30 päivän tutkimusjakson aikana DFCS-työntekijöiden on haastatteltava uhreja, tekijöitä ja vanhempia henkilökohtaisesti. vieraile lapsen kotona; tarkistaa kaikki tarvittavat asiakirjat ja historialliset tiedot; laajentaa haastatteluja naapureille, opettajille ja laajennetulle perheelle; ja tehdä ammatillisia arvioita lapsen turvallisuudesta, väärinkäytön todennäköisyydestä ja perheen tarpeista.
Yhdistyneessä kuningaskunnassa useimmat lasten hyväksikäyttöä koskeviin tutkimuksiin osallistuvat virastot noudattavat yhteistä viraston lähestymistapaa. Tämä tarkoittaa sitä, että lainvalvontaviranomaiset tekevät yhteistyötä lastensuojelualan ammattilaisten kanssa tutkinnan suorittamiseksi. Tällaisissa tapauksissa lainvalvontaviranomainen voi aluksi arvioida lapsen kunnon väärinkäytön merkkien varalta ja turvata epäillyn väärinkäytöksen. Lasten hyväksikäytön tutkinnan jatkuessa lastensuojeluhenkilöstö avustaa henkilökohtaisissa haastatteluissa ja tarvittavissa psykologisissa arvioinneissa lainkäyttöalueen mukaan.