Naudanlihan käsittely käsittää useita vaiheita lihan osien valmistamiseksi ja pakkaamiseksi toimitettavaksi säilyttäen samalla turvalliset olosuhteet elintarvikeperäisten sairauksien riskin rajoittamiseksi. Nautaa on mahdollista teurastaa ja käsitellä kotona kotikäyttöön tai vuokrata liikkuva teurastaja, joka suorittaa naudanlihan käsittelyn paikan päällä. Muissa tapauksissa maanviljelijät lähettävät eläviä nautoja käsittelylaitokseen, joka pystyy käsittelemään suuria määriä eläimiä kerralla. Valtion virastot säätelevät tällaisia tiloja ja valvovat niitä turvallisuus- ja terveysloukkausten varalta.
Ensimmäinen vaihe naudanlihan käsittelyssä on teurastus. Ennen teurastusta teknikko tutkii eläimen varmistaakseen, että se sopii ihmisravinnoksi. Teurastamot eivät käsittele sairaita nautaeläimiä, ja ne voidaan lailla kieltää käsittelemästä alaeläimiä ja muita eläimiä, joilla on ilmeisiä terveysongelmia. Jos eläin näyttää terveeltä, voidaan käyttää erilaisia tekniikoita teurastukseen ja verenvuotoon nopeasti pilaantumisen estämiseksi.
Verenvuodon jälkeen naudanlihan käsittely voi sisältää nahan poistamisen yhdessä jätteiden, kuten suoliston, kanssa ja ruhon leikkaamisen osiin. Käytettävissä oleva käsittelyaste riippuu laitoksesta. Jotkut tilat yksinkertaisesti poistavat jalkojen ja pään pohjat, puhdistavat sisäelimet ja leikkaa karjan puoliksi kuljetettavaksi toiseen paikkaan. Toiset voivat teurastaa ruhot osiin, kuten kylkiluut, kylkipihvit ja niin edelleen.
Tuotantolaitosten on pidettävä viileät ja puhtaat olosuhteet naudanlihan käsittelyssä. Prosessi voi sisältää vanhenemisen, jotta liha kypsyy ennen leikkaamista ja myyntiä, koska tuoreella lihassa voi joskus olla raaka, verinen maku jopa perusteellisen kypsentämisen jälkeen. Laitoksen työntekijät peittävät tyypillisesti hiuksensa, käyttävät käsineitä ja ryhtyvät muihin toimiin saastumisen rajoittamiseksi. Jalostettu liha on pidettävä viileänä pakkauksen jälkeen bakteerien kasvun estämiseksi.
Jotkut naudanlihan jalostusprosessit voivat sisältää kemiallisia käsittelyjä, säteilytystä tai muita toimenpiteitä, joiden tarkoituksena on rajoittaa lihan saastumisriskiä. Maatalouden tarkastajat luokittelevat myös lihan laadun perusteella, mikä määrittää myyntiarvon. Tarkastajat voivat myös tarkastella laitosta säännöllisesti varmistaakseen, että työntekijät noudattavat lakia. Terveyssääntöjen rikkomukset, kuten lämpimät lämpötilat, väärät päällysteet ja muut ongelmat, voivat johtaa laitoksen sulkemiseen, kunnes ongelma voidaan korjata.
Naudanlihan kotikäyttöön tarvitaan vähemmän tiukkoja toimenpiteitä. Kotitaloudet voivat käsitellä lihaansa monin eri tavoin tarpeidensa mukaan ja toteuttaa joitakin perusturvatoimenpiteitä lihan pitämiseksi puhtaana ja pilaantumisen estämiseksi. Näitä voivat olla tupakointi, suolaaminen tai peittaus lihan säilyttämiseksi sekä pakasteiden pakaste myöhempää käyttöä varten.