Epänormaalin tai vaurioituneen kudoksen alueet, joita kutsutaan vaurioiksi, ovat yleinen oire hankitun immuunipuutoksen oireyhtymästä (AIDS). On olemassa useita erilaisia AIDS -leesioita, jotka johtuvat opportunistisista infektioista ja syövistä, jotka hyökkäävät kärsivään, koska AIDS heikentää hänen immuunijärjestelmää. Näkyvimmät AIDS -leesioiden tyypit ovat iholla, mutta niitä voi esiintyä myös sisäelimissä, kuten aivoissa ja munuaisissa.
Suurin osa yleisöstä tunnetuimpia AIDS -vaurioiden syitä on Kaposin sarkooma, joka on Kaposin sarkoomaan liittyvän herpesviruksen aiheuttama syöpä veri- ja imusolmukkeissa. Se ei vaikuta useimpiin viruksen kantajiin, mutta henkilöllä, jolla on heikentynyt immuunijärjestelmä, se voi tuottaa nopeasti leviäviä pahanlaatuisia kasvaimia uhrin kehossa. Se näkyy yleensä ensin ihon kohonneina, tummennettuina leesioina, jotka ovat syntyneet verisuonten muodonmuutoksista, mutta edetessään se leviää joskus suuhun ja kehon sisälle. Muita virusinfektioita, joita tavallisesti esiintyy AIDS -potilailla ja jotka aiheuttavat ihovaurioita, ovat olluscum contagiosum ja sekä suun että sukupuolielinten herpes simplex -virus.
Muita aids -leesioita esiintyy hermostossa. Toksoplasmoosi, erittäin yleinen alkueläininfektio, joka on vaaraton useimmille ihmisille, mutta erittäin vaarallinen henkilölle, jolla on huonosti heikentynyt immuunijärjestelmä, voi aiheuttaa aivojen ja silmävaurioita AIDS -potilailla. Toinen yleinen ja yleensä vaaraton infektio, joka on vaarallista AIDS -potilaille, on etenevä multifokaalinen leukoenkefalopatia (PML). PML aiheuttaa aivojen valkoisen aineen vaurioita, jotka heikentävät moottorin hallintaa; näön, puheen ja persoonallisuuden muutokset; ja lopulta kuolema ilman hoitoa. Toinen yleinen syy aivovaurioihin AIDS -potilailla on eräänlainen kasvain, jota kutsutaan primaariseksi keskushermoston lymfoomaksi, joka voi aiheuttaa päänsärkyä, kohtauksia ja dementiaa.
Myös muille kehon alueille voi kehittyä vaurioita aidsin, siihen liittyvien opportunististen sairauksien tai AIDS -lääkkeiden sivuvaikutusten vuoksi. Kehittynyt Kaposin sarkooma voi aiheuttaa AIDS -vaurioita ruoansulatuskanavan, keuhkojen tai imusolmukkeiden sisällä. Huomattava osa aids -potilaista on myös hepatiitti C -tartunnan saaneita, mikä aiheuttaa maksavaurioita ja voi aiheuttaa myös pieniä ihovaurioita, yleensä jaloissa. Antiretroviraaliset lääkkeet, joita käytetään yleisesti aidsin kehittymisen hidastamiseen, voivat myös aiheuttaa maksavaurioita, jos niitä otetaan suuria määriä tai pitkiä aikoja. Jotkut AIDS-potilaat kehittävät HIV: hen liittyvää nefropatiaa, mikä aiheuttaa munuaisvaurioita ja voi lopulta aiheuttaa munuaisten vajaatoiminnan.