Biomagnisoidut epäpuhtaudet ovat epäpuhtauksia, jotka keskittyvät enemmän, kun ne siirtyvät elintarvikeketjussa ylöspäin. Useat tutkimukset ovat viitanneet siihen, että useilla kemikaaleilla on taipumus biomagnisoitua, mukaan lukien jotkut kemikaalit, joita aiemmin pidettiin turvallisina. Sen lisäksi, että biomagnifiointi uhkaa ympäristön hyvinvointia, se aiheuttaa riskin myös ihmisille, erityisesti ihmisille, jotka kuluttavat eläinperäisiä tuotteita.
Biomagnifikaatio liittyy läheisesti biokertymän käsitteeseen, joka viittaa epäpuhtauden kertymiseen tiettyyn organismiin. Myrkyt kertyvät biokerrokseen monista syistä. Ne ovat yleensä vähemmän vesiliukoisia, mikä vaikeuttaa organismin huuhtelua, ja ne voivat kiinnittyä rasvasoluihin ja kerääntyä organismin kudoksiin. Biokertyminen voi olla tappavaa yhdelle eläimelle, mutta se voi myös edistää biomagnifikaatiota.
Klassisessa esimerkissä biomagnifikaatiosta valtameren mikro -organismit altistuvat epäpuhtauksille, ja niitä syövät kalat nauttivat myös näitä epäpuhtauksia. Suuremmat kalat syövät pienempiä kaloja ja suuret kalat hylkeet. Saastuttavan aineen pitoisuus kasvaa koko ajan, mikä edustaa kymmenien tai satojen eläinten aiheuttamaa saastumista. Kun jääkarhu syö hylkeen, biomagnisoidut epäpuhtaudet kerääntyvät ennennäkemättömälle tasolle jääkarhun kehossa aiheuttaen jäätikön sairastumisen, geneettisten poikkeavuuksien siirtämisen lapsilleen tai kuoleman.
Yksi biomagnisoidun epäpuhtauden suurista ongelmista on se, että niiden tunnistaminen voi olla vaikeaa ennen kuin ne ovat saavuttaneet ravintoketjun korkeammat tasot. Yllä olevassa jääkarhuesimerkissä voi kestää vuosikymmeniä, ennen kuin epäpuhtaudet ilmaantuvat jääkarhupopulaatiossa, jolloin on liian myöhäistä ryhtyä toimiin niiden esiintyvyyden vähentämiseksi ilmakehässä ja meressä. Tutkijat voivat päätellä, että biomagnifioidut epäpuhtaudet saavat jääkarhun sairastumaan, mutta he eivät voi ryhtyä olennaisiin toimiin estääkseen useampia jääkarhuja sairastumasta. .
Biomagnisoidut epäpuhtaudet ovat erityisen huolestuttavia sääntelyvirastoille, koska näiden virastojen on pohdittava epäpuhtauksien vaikutuksia paitsi yksittäisiin organismeihin myös koko elintarvikeketjuun. Jos kemikaali hyväksytään markkinoille ja se myöhemmin osoittautuu tieteellisessä tutkimuksessa biomagnisoiduksi epäpuhtaudeksi, tämä voi heijastua huonosti sääntelyorganisaatioihin, joiden on tarkoitus suojella ympäristöä.