Mikrobiset hyönteismyrkyt ovat torjunta -aineita, jotka toimivat tartuttamalla valitut hyönteispopulaatiot bakteereilla, viruksilla, ameeboilla tai sienillä. Vaikka tämä kuulostaa mahdollisesti vaaralliselta, monet väittävät, että se on itse asiassa varsin turvallinen, koska hyönteismyrkky on ominaista kohdelajille. Näillä torjunta -aineilla ei yleensä ole vaikutusta eläinpopulaatioihin, ellei tietyn vian väheneminen alueella keskeytä ravintoketjua. Kukin tyyppi toimii yleensä vain yhtä hyönteistyyppiä vastaan.
Bakteeriperäisiä hyönteismyrkkyjä voidaan käyttää hallitsemaan tiettyjä toukkalajeja, jotka syövät satoa. Ne kuitenkin tappavat sekä koiden että perhosten toukat, ja niitä tulisi käyttää vain silloin, kun ne eivät vähennä perhoskantaa. Normaalisti tämä valmiste ruiskutetaan suoraan viljelykasveille. Yksi bakteerituote toimii erityisesti hyttyspopulaatioissa. Sitä pidetään erittäin hyödyllisenä poistettaessa populaatioita, jotka voivat levittää mahdollisesti tappavaa Länsi -Niilin virusta.
Useat virusmikrobiset hyönteismyrkyt pyrkivät ensin sairastamaan ja tappamaan joitain hyönteislajeja. Ne voivat vaikuttaa koihin ja sahoihin käytetyn viruksen mukaan. Sienien hyönteismyrkkyjä voidaan käyttää torakoihin ja ne voivat aiheuttaa sairauksia koko populaatiossa. Ameebiset eivät välttämättä tappaa hyönteisiä, mutta voivat lyhentää sen elinikää tai estää sitä saavuttamasta sukupuolikypsyyttä.
Mikrobiologiset hyönteismyrkyt voivat olla hyödyllisiä yksittäisten hyönteistyyppien tappamisessa, mutta ihmiset, joilla on useita erityyppisiä vikoja, voivat vaatia useiden eri suihkeiden käyttöä. Koska nämä tuotteet ovat niin lajikohtaisia, ne eivät todennäköisesti vahingoita muita vikoja, jotka syövät tai saastuttavat kasveja, joten ne eivät välttämättä vähennä kaikkia tartuntoja samanaikaisesti.
Nämä torjunta -aineet ovat myös alttiimpia ulkoisille tekijöille. Pitkä altistuminen auringolle tai rankkasateet voivat tappaa esimerkiksi tiettyjä bakteereja. Siksi hyönteisten populaatioita hallitsevien yrittäjien on ajoitettava levitys huolellisesti maksimaalisen vaikutuksen saavuttamiseksi.
Jotkut tutkijat ovat ilmaisseet huolestuneisuutensa mikrobien hyönteismyrkkyjen turvallisuudesta. Asiantuntijat tietävät varmasti, että elävät olennot, jopa mikroskooppisella tasolla, muuttuvat ja kehittyvät, samoin kuin niihin vaikuttavat olennot. Tietyt viat voivat kehittää vastustuskykyä bakteereille tai viruksille, joita käytetään niiden tappamiseen, tai hyönteismyrkyt voivat muuttua ja vaikuttaa muihin populaatioihin. Nämä epävarmuudet koskevat joitain ympäristönsuojelijoita, jotka pitävät mikrobilääkkeiden laajaa käyttöä mahdollisesti vaarallisena tulevaisuudessa.
Toiset ympäristönsuojelijat juhlivat kuitenkin toistaiseksi sellaisten lajikohtaisten aineiden kehittämistä, jotka näyttävät paremmalta vaihtoehdolta useammin käytetyille myrkyille. Nämä henkilöt väittävät, että mikrobit hyönteismyrkyt tarjoavat tavan päästä eroon haitallisista hyönteisistä pitämällä hyödylliset hyönteiset turvassa.