Epäsuorat valmistuskustannukset – joita kutsutaan myös valmistuksen yleiskustannuksiksi, tehtaan yleiskustannuksiksi tai valmistuksen tukikustannuksiksi – ovat kohteita, jotka eivät mene suoraan tuotettuihin tavaroihin tai palveluihin. Yritys vaatii nämä kustannukset voidakseen suorittaa koko tuotantoprosessin eikä tuottaa yksittäistä tuotetta. Epäsuoria valmistuskustannuksia ovat esimerkiksi vuokra, rakennusten tai laitteiden poistot ja ylläpito rakennusten turvallisuuden, laadunvalvontamenojen ja kaikkien tavaroiden tuotantoon tarkoitettujen pienten materiaalien lisäksi. Johtavien kirjanpitäjien on kirjattava nämä kustannukset tilille ja osoitettava sitten osa niistä kullekin tuotetulle tuotteelle. Lyhyesti sanottuna nämä kustannukset muodostavat yhden suuren tuotantokustannusten ryhmän.
Kaikilla yrityksillä on jonkinlaisia välillisiä valmistuskustannuksia. Niissä yrityksissä, jotka eivät valmista fyysisiä tavaroita, näillä epäsuorilla kustannuksilla on nimi yleiset, myynti- ja hallintokulut. Kustannuksilla ei ole suoraa yhteyttä yrityksen tavaroihin tai palveluihin. Sen sijaan kustannukset tarjoavat resursseja kaikille yksiköille ja yrityksessä työskenteleville henkilöille. Kustannuksia alentavat yritykset etsivät usein näitä välillisiä kustannuksia löytääkseen alueita, joilla kustannusten leikkaaminen säästää rahaa ilman, että yrityksen toiminnan laatu heikkenee.
Valmistusyritykset kirjaavat epäsuorat valmistuskustannukset yhdelle tilille, joka on merkitty valmistuskustannuksiksi. Tämän tilin saldo ei ole koskaan nolla; täällä on aina jonkin verran kustannuksia, kunhan yritys tuottaa tavaroita. Kun erä tavaraa menee tuotantojärjestelmän läpi, johtavat kirjanpitäjät laskevat epäsuorien valmistuskustannusten määrän, joka kohdistetaan näille tuotteille. Joissakin tapauksissa yritys voi käyttää ennalta määrättyä yleiskustannusta näiden kustannusten kattamiseksi. Tämä korko edustaa tehtaiden yleiskustannusten odotettua määrää valmistetuille tavaroille.
Ennalta määrätty yleiskustannus edustaa standardin mukaista valmistuskustannusta, joka tarvitaan yksittäisen tavaran tuottamiseen. Esimerkiksi johtavat kirjanpitäjät tarkistavat tietyn määrän tavaroiden tuottamiseen tarvittavia valmistuksen yleiskustannuksia. Tällöin kokonaiskustannustekijä-kuten työ- tai konetunnit-on tarpeen tehtaan yleiskustannusten yksikköhinnan määrittämiseksi. Kun valmistuksen yleiskustannukset jaetaan odotettavissa olevilla kokonaiskustannustekijöillä, saadaan tarvittava ennalta määrätty yleiskustannus. Jos tämä kustannusyksikkökohtainen kustannus kohdistetaan kaikille tuotetuille tavaroille, tehtaan yleiskustannukset siirretään valmistuskustannuksista yrityksen tuottamiin tavaroihin.