Vesiskootteripäällysteitä käytetään estämään aurinko ja muut elementit vaurioittamasta vesikulkuneuvojen tarroja, maalia ja vinyyliä ylivalotuksen vuoksi. Tyypillisesti Naugahyde ™ -materiaalista, nailonista tai muusta vettä hylkivästä materiaalista valmistetut vesiskootterisuojat suojaavat myös vesikulkuneuvoa sadevedeltä ja muilta mahdollisesti vahingollisilta aineilta, kuten lintujen ulosteilta, puhaltavalta roskilta, hiekalta ja lehdiltä. Vesiskootterit valmistetaan ja myydään yleisesti tietyntyyppisiin vesikulkuneuvoihin räätälöityinä. Monet jälkimarkkinoiden valmistajat tuottavat kansia lukuisissa väreissä, malleissa ja mukautetuissa grafiikkapaketeissa.
Vesiskootterityyppinen vesikulkuneuvo on suunniteltu selviytymään vedessä ja auringonpaisteessa, mutta toistuva ja pitkäaikainen altistuminen ankarille ympäristöolosuhteille, jotka löytyvät suurelta vesistöltä ja sen läheltä, voivat vaikuttaa koneen maaliin. Asettamalla vesiskootterien suojukset alusten päälle, kun niitä ei käytetä, maali ja tarrat voivat säilyttää alkuperäisen valmistusprosessin värin. Tiiviit kannet poistavat myös suuren osan sateesta ja kosteudesta, joka voi päästä ilmanottoaukkoihin, mikä voi vahingoittaa ilmanpuhallussuodattimia, polttoaineen ruiskutusyksiköitä ja kaasuttimia.
Jatkuva altistuminen auringonvalolle ja lämmölle voi aiheuttaa vesikulkuneuvoissa käytettävän vaahdon hajoamisen ja kovettumisen ja haurastumisen. Vesiskootterien asettaminen pysäköityjen vesikulkuneuvojen päälle auttaa istuimia säilyttämään alkuperäisen taipuisansa vuosien ajan. Istuinmateriaalien värjäämiseen käytetyt värit on myös suojattu auringon tylsiltä ultraviolettivaikutuksilta, kun niitä säilytetään vesiskootterin peittojen alla. Tärkein etu on myös se, että monet kuluttajat ostavat ensinnäkin kannen, joka pitää astian puhtaana ja ilman putoavia lehtiä, pölyä ja vastaavia epäpuhtauksia.
Jotkut halvemmista vesiskootterisuojista on tarkoitettu käytettäväksi vain pysäköidyssä vesikulkuneuvossa. Nämä kannet on tyypillisesti varustettu koukku- ja silmukkakiinnikkeillä ja ne on valmistettu kevyistä materiaaleista. On kuitenkin olemassa kalliimpi vaihtoehto, joka tarjoaa suojan kivipurskeilta ja muilta tien roskivaurioilta vesiskootterin hinauksen aikana. Yleensä paksummasta ja usein vuoratusta materiaalista, jossa on kiinnityslenkit ja teräksiset läpivientikiinnityspisteet, nämä vesiskootterit on tehty matkoille. Raskaampi matkakotelo suojaa vesikulkuneuvoa vaurioilta, kun sitä kuljetetaan perävaunulla ratsastuspaikalle, eikä se puhalla helposti irti koneesta kuin kevyemmät vesiskootterit.