Yleensä tilintarkastajan ensisijainen tehtävä on valvoa tarkastusosaston toimintaa. Tämä osasto varmistaa, että talousraportit ovat käytäntöjen, lakien ja asetusten mukaisia. Johtajan tehtävänä on suunnitella erilaisia tehtäviä johtotasolta ja siirtää tehtävät tarvittaessa alaisille. Yleensä hänen tehtäviinsä kuuluu auditointien suorittaminen alan hyväksyttyjen tilintarkastuskäytäntöjen mukaisesti, henkilöstön palkkaaminen ja kouluttaminen sekä sen varmistaminen, että tarkastusmenettelyt täyttävät lakisääteiset vaatimukset.
On organisaatioita, joilla on omat sisäisen tarkastuksen tiiminsä. Tällaisissa organisaatioissa tilintarkastaja suunnittelee ja ohjaa tarkastustehtäviä. Kun tarkastus suoritetaan, johtajan velvollisuus on tutkia perusteellisesti taloudelliset tiedot ja varmistaa niiden paikkansapitävyys. Aiempien suurten talouspetosten ja kirjanpidollisen epärehellisyyden vuoksi tilintarkastusjohtajan on varmistettava, että hänen tiiminsä valvoo tiukasti taloudellisten raporttien valvontaa, jotta voidaan säilyttää korkea eheys.
Lakien, käytäntöjen ja määräysten noudattamisen varmistamisen lisäksi tilintarkastaja voi joutua suorittamaan tutkimuksia, jos epäillään petosta. Petoksella on vakavia seurauksia, ja johtajan on oltava perusteellinen tarkastuksessaan. Kun se paljastuu, johtajan velvollisuus on ilmoittaa asiasta asianomaisille viranomaisille.
Erikoistuminen on myös osa auditointia. Esimies voi esimerkiksi hankkia tietotekniikka -alan asiantuntemusta. Esimerkiksi esimies, jolla on asiantuntemusta tällä alalla, yleensä valvoo ja hallitsee tiedonhallintaa. Näin hän varmistaa, että arkaluonteisia tietoja ei menetetä tai käsitellä muun muassa.
Joillakin organisaatioilla ei ole sisäisiä tarkastajia, ja ne luottavat lähinnä tähän alaan erikoistuneisiin yrityksiin. Kun organisaatio palkkaa yrityksen, joka tarjoaa tilintarkastuspalveluja, prosessin valvonnassa on tilintarkastaja. Johtaja tutkii tilinpäätöksen varmistaakseen, ettei siinä ole sääntöjenvastaisuuksia. Lisäksi hän analysoi organisaation käytössä olevat kontrollit ja mittaa siten niiden tehokkuuden ja vaikuttavuuden.
Tarkastuspäällikkö voi myös työskennellä valtiolla. Tässä roolissa johtaja voi olla vastuussa eri toimintojen valvonnasta. Näihin kuuluvat yksityishenkilöiden ja yritysten tarkastukset, erityisesti silloin, kun epäillään veropetosta, rahanpesua tai muuta rikollista toimintaa.
Useimmiten tilintarkastuspäällikön tehtävät edellyttävät, että hakijalla on tutkinto joko sisäisestä tarkastuksesta tai kirjanpidosta, mieluiten jatkotason. Lisäksi häneltä voidaan vaatia yksi useista alan sertifikaateista. Näitä ovat muun muassa sertifioitu sisäinen tarkastaja (CIA), sertifioitu sisäinen järjestelmätarkastaja (CISA) ja sertifioitu kontrollin itsearviointi (CCSA).