Mucociliary, “limakalvojen” ja “silmäripsien” portaali, kuvaa hengitysteitä vuoraavia erikoistuneita epiteelikalvoja. Nämä kalvot sisältävät lukuisia hienoja karvoja, jotka tunnetaan nimellä silmät, sekä limaa tuottavia soluja, jotka peittävät silmät ohuella nestekerroksella. Lima vangitsee hiukkaset, kun ne tulevat hengitysteihin, ja silmät kuljettavat vieraan aineen turvallisesti pois, ennen kuin se pääsee keuhkoihin ja aiheuttaa sairauksia. Joissakin erityistapauksissa, kuten kystisessä fibroosissa, potilaat tuottavat liikaa limaa ja voivat tukkia hengitystiet.
Limakalvot ovat osa immuunijärjestelmän puolustusta vihamielisiä organismeja vastaan ja ne ovat erittäin tärkeitä hengitysteiden terveydelle. Jos hiusten määrä vähenee, ympäristö kuivuu liikaa tai silmäripsien liike heikkenee, ihmiset ovat alttiimpia infektioille ja muille terveysongelmille. Ihmiset, jotka tupakoivat tai työskentelevät ympäristössä, jossa on myrkyllisiä aineita, ovat vaarassa kehittää ongelmia näiden kalvojen kanssa yhdessä erittäin kuivassa ilmastossa olevien ihmisten kanssa.
Hiukkasten kerääminen ja siirtäminen tunnetaan mukociliaarisena hissinä tai kuljetusjärjestelmänä. Bakteerit, virukset ja materiaalit, kuten siitepöly, kaikki uppoavat limaa hengitysteitä pitkin, kun ihmiset hengittävät sisään sen sijaan, että ne kuljetettaisiin keuhkoihin. Silmät lyövät tasaisesti työntääkseen nämä materiaalit ylös suun suuntaan. Ihmiset voivat joko niellä ne nielemällä eritteitä tai yskätä niitä, jos ne tuottavat paljon limaa, kuten jos kyseessä on joku, jolla on tulehduksen tai infektion aiheuttama keuhkojen tai hengitysteiden ärsytys.
Hengitysteiden trauma voi vahingoittaa limakalvojärjestelmää. Intubaatio, jossa hoitopalvelujen tarjoajat asettavat putken henkitorveen hengitysteiden turvaamiseksi, voivat mahdollisesti vahingoittaa hengitysteitä, samoin kuin toiminnot, kuten mittaaminen materiaalin keräämiseksi lääketieteellistä diagnoosia varten. Lääkärit noudattavat varovaisuutta toimenpiteiden aikana, kun heidän on päästävä hengitysteihin, ja vain silloin, kun hyödyt ovat suuremmat kuin riskit; Intubaatio voi esimerkiksi pelastaa potilaan hengen varmistamalla, että hän saa tarpeeksi happea.
Syöpiin ja muihin ongelmiin liittyvät hengitysteiden vauriot voivat myös häiritä mukociliaarista hissiä. Tämä vaikeuttaa ihmisten keuhkoinfektioiden ehkäisemistä ja torjumista. Ihmisillä, joilla on heikentynyt immuunijärjestelmä, tämä lisää riskiä ongelmiin, kuten keuhkokuumeeseen. Joillakin potilailla on vaikeuksia yskää tai niellä eritteitä, ja heidän on ehkä käytettävä imulaitetta säännöllisesti hengitysteiden pitämiseksi puhtaina, koska muuten heillä voi olla hengitysvaikeuksia.