ITunes® -kaupalle on lukuisia vaihtoehtoja, joista jokaisella on omat vahvuutensa ja heikkoutensa ja joista jokainen on saatavana useilla eri tietokonealustoilla. Nämä vaihtoehdot mahdollistavat tyypillisesti samanlaiset toiminnot kuin iTunesin® kautta saatavilla olevat, jolloin henkilö voi järjestää ja hallita iPodiaan® sekä merkitä kappaleita ja suoratoistaa digitaalista Internet -radiota soittimelleen. Joitakin suosittuja esimerkkejä vaihtoehdoista iTunes® -kaupalle ovat Winamp®, SharePod ja MediaMonkey.
Laitteiston, ohjelmiston ja elämäntapojen integroinnin ansiosta Apple® saavutti merkittävää menestystä julkaisemalla iPod®in ja ottamalla käyttöön iTunes® -myymälän, jossa käyttäjät voivat ostaa musiikkia ja hallita soittimessa olevia kappaleita. Jotkut iPod® -käyttäjät eivät kuitenkaan välitä iTunesista® ja haluavat vaihtoehdon iTunes® -kaupalle ja sen medianhallintajärjestelmille. Useat eri yritykset ja ohjelmistot ovat vastanneet tähän puheluun tarjoamalla näitä vaihtoehtoja tietokoneen käyttäjille.
Nämä muutamat esimerkit eivät ole millään tavalla kattavia, ja ne ovat vain esimerkki ohjelmista, jotka löytyvät ja joita voidaan käyttää iPod® -hallintaan. Winamp® on ohjelma, joka on ollut saatavilla yli kymmenen vuoden ajan ja joka tarjoaa ääni- ja videosoittimen Windows® -käyttäjille. Ohjelman uusimpiin versioihin on sisältynyt myös iPod® -tuki, ja sitä voidaan käyttää kappaleiden ja soittolistojen hallintaan sekä soittimen synkronointiin eri podcastien ja suoratoistopalvelujen kanssa. Winamp® tarjoaa satoja räätälöityjä ulkoasuja ja lisäosia, ja se on hyödyllinen vaihtoehto iTunes®-kaupalle ja joustavuutta kaikille tietokoneen käyttäjille.
SharePod on ohjelma, jota voidaan käyttää suoraan iPodista®, jolloin joku, jolla ei ole järjestelmänvalvojan oikeuksia asentaa ohjelma tietokoneeseen, voi käyttää sitä edelleen. Vaikka jotkut ihmiset, jotka etsivät vaihtoehtoja iTunes® -kaupalle, saattavat pitää sitä jonkin verran rajoittavana ja rajoitetusti toiminnallisena, peruskäyttäjille se voi tyydyttää suurimman osan iPodin® perustarpeista. Se on yksinkertainen ja helppokäyttöinen, mutta ei tarjoa laajan valikoiman muita ohjelmia.
MediaMonkey on toinen vaihtoehto, ja se mahdollistaa korkean tason toiminnallisuuden ja personoinnin käyttäjälle. Vaikka kokeneet käyttäjät todennäköisesti arvostavat ohjelman sallimia lukuisia toimintoja ja vaihtoehtoja, jotkut käyttäjät saattavat pitää sitä ylivoimaisena. Viime kädessä yksittäisten käyttäjien on löydettävä heille sopiva ohjelma ja löydettävä intuitiivisten asettelujen ja joustavuuden optimaalinen yhdistelmä etsiessään vaihtoehtoja iTunes® -kaupalle.