Vesilohikäärmeen ruokavalion tulisi yleensä sisältää noin kymmenen prosenttia kalsiumia ja fosforia sisältäviä vihanneksia ja hedelmiä sekä joitain hyönteisiä ja syöttöeläimiä, mukaan lukien vauvahiiret, linnunpoikaset tai kalat. Useimmat vesilohikäärmeet tarvitsevat ruokansa mineraalilisäjauheella päällystettynä vähintään kerran viikossa, elleivät he syö kokonaista saalista sisältävää ruokavaliota. Hyönteisten tulisi yleensä muodostaa pienempi osa vesilohikäärmeen ruokavaliosta, koska hyönteisten liiallinen ruokinta voi aiheuttaa vaarallisen suolen tukkeutumisen vesilohikäärmeissä. Oikean, tasapainoisen ruokavalion lisäksi useimmat vesilohikäärmeet on altistettava UVA/UVB -valolle noin 12 tuntia päivässä. Tämä mahdollistaa niiden kehon omaksua ja käyttää syömänsä kalsiumia.
Matelijat, kuten vesilohikäärme, tarvitsevat yleensä paljon kalsiumia, proteiinia ja fosforia ruokavaliossaan. Siksi herpetologit suosittelevat yleensä ruokkimaan näitä eläimiä ruokavaliossa, joka on raskas ruokintaeläimillä. Vauvahiiriä, vauvanrottia, pieniä poikasten lintuja ja pieniä kaloja pidetään hyvänä saalislajina näille eläimille. Nuoria jyrsijöitä, jotka ovat tarpeeksi vanhoja kasvattamaan hieman turkista, pidetään parhaana proteiinin ja muiden mineraalien lähteenä vesilohikäärmeille. Tällaisten eläinten tulisi yleensä olla 20–40 prosenttia vesilohikäärmeen ruokavaliosta.
Useimmat asiantuntijat suosittelevat ruokkimaan lohikäärmeitä vain kuolleille jyrsijöille. Elävät jyrsijät voivat hyökätä vesitahnaa vastaan tai taistella sitä vastaan. Tämä voi aiheuttaa matelijavamman, infektion ja jopa kuoleman.
Jotkut vihannekset ja hedelmät voivat tehdä terveellisen lisäyksen vesilohikäärmeen ruokavalioon. Mansikat, viikunat, cantaloupes ja vadelmat ovat esimerkkejä hedelmistä, jotka voivat tarjota vesilohikäärmeelle runsaasti terveyteen tarvittavia vitamiineja ja kivennäisaineita. Squash, palsternakka, vihreät pavut ja voikukka vihreät ovat yleensä myös ravitsemuksellisesti sopivia. Kaikki vesilohikäärmeet eivät kuitenkaan nauti näistä elintarvikkeista. Vesi -lohikäärmeitä, jotka eivät syö vihanneksia tai hedelmiä, voidaan ruokkia vielä kymmenen prosenttia syöttöeläimillä.
Kastematoja pidetään yleensä hyödyllisenä osana vesilohikäärmeen ruokavaliota, koska ne sisältävät suuria määriä vesilohikäärmeiden tavallisesti tarvitsevaa proteiinia, fosforia ja kalsiumia. Jotkut asiantuntijat ehdottavat, että lieroista yksinään voi muodostua jopa 20 prosenttia vesilohikäärmeen ruokavaliosta. Muuntyyppiset hyönteiset, yleensä ateriamatot ja sirkat, voivat muodostaa 40–50 prosenttia liskojen ruokavaliosta. Matelijoille tarkoitettua mineraalilisää tulisi yleensä ripotella hyönteisten päälle vähintään kerran viikossa, jotta vesilohikäärmeet saavat riittävästi kalsiumia ja fosforia ruokavalioonsa. Ilman riittävää mineraalien saantia nämä olennot voivat sairastua vakavasti.