Kirurgiset toimenpiteet poistavat syyliäsi, mutta koska ne eivät paranna syyliä aiheuttavaa virusta, ihmisen papilloomavirusta (HPV), syyliä voi tulla takaisin. Syylät voidaan poistaa kirurgisesti sähkökirurgialla ja kuretaasilla tai laserleikkauksella. Useimmissa tapauksissa kirurginen syylän poisto suoritetaan avohoidossa ja vaatii vain paikallispuudutusta.
Lääkärit suosittelevat tyypillisesti syylän poistotyyppiä, jonka he arvelevat vähiten aiheuttavan arpia. Esimerkiksi jalkapohjat kasvavat jalkapohjilla; kun ne kasvavat klustereissa, niitä kutsutaan mosaiikkisyyliksi. Käyttämällä kirurgisia menetelmiä istukan syylän poisto voi aiheuttaa merkittäviä arpia, joten lääkärit suosittelevat leikkausta vasta sen jälkeen, kun syylän ei-kirurgiset poistomenetelmät ovat epäonnistuneet.
Sähkökirurgiassa ja kuretaasissa lääkäri asettaa neulan syylälle. Menetelmässä, joka tunnetaan elektrodisaationa, syylän kudokset poltetaan neulan läpi kulkevalla sähkövirralla. Loput kuolleet kudokset kaavitaan sitten kurettalla, lusikkaa muistuttavalla teräväreunaisella välineellä. Leikkauksen jälkeen alue on pidettävä puhtaana ja kuivana.
Sähkökirurgia ja curettage on tehokas menetelmä syylän kirurgiseen poistamiseen, ja se kestää vain noin 30 minuuttia. Verrattuna laserleikkaukseen tämä toimenpide on suhteellisen halpa. Sähkökirurgian ja kuretaasin yleisin sivuvaikutus on arpia. Muita mahdollisia sivuvaikutuksia ovat hermovaurio, hidas paraneminen ja infektioriski.
Laserleikkauksessa lääkäri käyttää suuritehoista valonsädettä syylän kirurgiseen poistamiseen. Tässä leikkauksessa käytetään kahdenlaisia lasereita: pulssivärilasereita ja hiilidioksidilasereita. Pulssiväriainelaserit hyökkäävät syylän verisuoniin nälkään ja aiheuttavat sen putoamisen. Toistuvat hoidot pulssiväriainelasereilla ovat usein välttämättömiä syylän poistamiseksi. Hiilidioksidilaserit toimivat veitsellä leikkaamaan syylä pois ja vaativat vain yhden hoidon.
Itsepäisille tai useille syylille, jotka ovat levinneet laajalle alueelle, laserleikkaus on paras tapa syylän kirurgiseen poistamiseen. Se ei ole vain tehokas tavallisille syylisille ja istukkaille, vaan se poistaa myös sukupuolielinten syyliä. Laserleikkaus on kuitenkin kallista, ja toipumisaika voi kestää jopa viisi viikkoa. Toinen laserleikkauksen haittapuoli on se, että se voi poistaa kaiken immuniteetin, jonka keho on rakentanut syyliä vastaan kyseisellä alueella, mikä tekee syyliöiden uudelleenkasvusta todennäköisempää.