Aurinkokunta muodostui tiivistyneestä alueesta paikallisessa pölypilvessä. Läheiset supernovaräjähdykset häiritsivät pölypilven tasapainoa yli viisi miljardia vuotta sitten, mikä loi tiheyden nuggetin, jonka keskelle aurinkomme muodostui. Voimme havaita näitä pilviä tänään muillakin galaksin alueilla – niitä kutsutaan Bok -palloiksi. Koska ne ovat suhteellisen tiheitä pölypilviä, Bok -pallot estävät valon niiden sisällä ja takana olevista esineistä, koska ne ovat alaluokka tummia sumuja. Tämä tekee mahdottomaksi seurata suoraan uusien tähtien muodostumista, vaikka astrofysiikan simulaatiot antavat meille hyvän käsityksen siitä, miten se toimii.
Alkaen epäsäännöllisenä pilvenä, kun painopiste oli muodostettu, monet varhaisen aurinkokunnan muodostavista pilven pölyhiukkasista olisivat alkaneet siirtyä säännöllisemmille kiertoradille kiertäen vastasyntynyttä tähteä protoplanetaarisena kiekkona. Pilven sisällä planeettoihin tiivistyi suuria kivikappaleita, jotka pyyhkäisivät kiertoradansa puhtaiksi materiaalista ja integroivat sen itseensä. Jupiter, joka oli planeettojen massiivisin, teki todennäköisesti paljon lakaistaan. Monet tähtitieteilijät uskovat, että Jupiter on itse asiassa voinut tehdä elämän maapallolla mahdolliseksi absorboimalla suuren osan aurinkokuntamme kulkevista kivistä ja estäen siten niitä vaikuttamasta muihin planeettoihin, kuten omaan.
Kymmenien tai satojen miljoonien vuosien jälkeen suurin osa aurinkokunnan roskista joko poistettiin planeetoilta tai siirrettiin vakaille kiertoradoille, jotka resonoivat planeettojen kanssa. Siksi useimmat asteroidit ja avaruusromut on lokalisoitu suhteellisen tarkkoihin vyöhykkeisiin, kuten Marsin ja Jupiterin väliseen pääasteroidivyöhykkeeseen ja Kuiperin vyöhykkeeseen Neptunuksen kiertoradan ulkopuolella.
Tähtitieteilijät teorioivat, että useimmat aurinkokunnat muodostuvat suunnilleen samalla tavalla, vaikka massiivisempien tähtien osalta vakaat kiertoradat ovat kauempana. Monet tähdet ovat myös binaarijärjestelmien jäseniä, jolloin tähdet itse pyyhkivät enemmän roskia kuin planeettakumppaninsa. Viime vuosina tiedemiehet ovat löytäneet satoja aurinkokunnan ulkopuolisia planeettoja, ja vaikuttaa turvalliselta vedolta, että suurin osa tähdistä on niitä. Uusia aurinkokuntia muodostuu koko ajan, ja niitä usein katalysoivat supernovaräjähdykset, jotka siementävät tähtipilviä raskailla elementeillä.