Usein munanjohtimen kysta poistuu itsestään ilman tarkoituksellista hoitoa. Tästä syystä jotkut lääketieteen ammattilaiset haluavat odottaa ennen kuin yrittävät kutistua tai poistaa kirurgisesti tämän alueen kystin. Kun kysta alkaa kasvaa suuremmiksi ja aiheuttaa kipua tai häiritsee naisen lisääntymisjärjestelmää, yleisin hoitomuoto on kuitenkin kystin kutistaminen hormonitoiminnalla tai sen poistaminen leikkauksella.
Hoidon kanssa tai ilman sitä ei ole harvinaista, että nainen, jolla on jo ollut kysta, kehittää uusia, jotka kasvavat joko suoraan lisääntymiselimissä tai näiden elinten vieressä. Yksi tämän sairauden yleisimmistä syistä on endometrioosi. Naisen kohdun vuoraus on pehmytkudos, joka tunnetaan endometriumina, ja joka kuukausi hänen säännöllisen kuukautiskiertonsa aikana tämä kudos poistetaan kohdusta. Kun toimintahäiriö ilmenee tässä prosessissa, endometrium voi kuitenkin alkaa levitä muihin sisäelimiin, kuten munasarjoihin tai munanjohtimeen, ja muodostaa arpikudosta sekä kystat.
Siksi munanjohtimen kystahoito sisältää yleensä myös endometrioosin hoidon. Yleisimpiä syitä tämän sairauden oireet ovat usein päällekkäin kysta -oireiden kanssa, kuten epätavallisen kivuliaat kuukautiskivut, tiputtelu kuukautisten välillä, kipu yhdynnän aikana, veriset ulosteet ja lantion kipu. Kun munanjohtimen kysta esiintyy endometrioosin seurauksena, lääketieteen ammattilainen voi päättää poistaa tämän kudoksen kertymisen kirurgisella toimenpiteellä. Jos kysta ei näytä kasvavan tai se ei aiheuta vakavia oireita, terveydenhuollon tarjoaja voi halutessaan korjata sen vähemmän invasiivisilla tavoilla, kuten määräämällä ehkäisypillereitä naisen hormonien manipuloimiseksi ja aiheuttamaan kysta kutistumisen samalla ehkäisee uusien kudosten kerääntymistä ja uusien kystien muodostumista.
Nämä kystat ovat yleensä hyvänlaatuisia, mutta jotkut voivat aiheuttaa hedelmättömyyttä naisilla. Vaikka tämä tila on harvinaisempi syy lapsettomuuteen, on mahdollista, että kohdun limakalvo munanjohtimissa voi estää hedelmöittymisen edellyttämien munien kulun. Jopa ilman kivuliaita oireita, kohdun limakalvo löytyy joskus hedelmättömyyden syiden tutkinnan aikana ja sitä hoidetaan hormonitoiminnalla raskauden todennäköisyyden parantamiseksi.
On olemassa vaara, että munanjohtimen kystiä ei hoideta, minkä vuoksi terveysasiantuntijat sanovat, että kysta -kasvun ja oireiden säännöllinen seuranta on tärkeää. Esimerkiksi endometrioosin aiheuttamat kystat voivat myös lopulta johtaa kohdunulkoiseen raskauteen tai aiheuttaa lantion tarttumisten kehittymistä ja johtaa komplikaatioihin, joihin liittyy munanjohtimia. Kun näitä ehtoja ilmenee, leikkaus on usein ainoa hoitovaihtoehto.