Tyypillisesti asiantuntijat haaraavat vesiviljelykulttuurin vähintään viiteen luokkaan: passiivinen, tulva ja tyhjennys, tippuminen, syvä vesi ja NFT. Jotkut ihmiset pitävät parempana termejä laskuvesi ja virtaus kuin tulva ja viemäri ja sprinkleri termiin tippuminen. Jokaisella järjestelmällä on etuja ja haittoja, ja parhaan järjestelmän valinnassa viljelijän on otettava huomioon kaikki tekijät. Valitsenpa kenen tahansa, hänen on seurattava kasvin ja sen juurien lämpötiloja, liuoksen pH- ja ravinnepitoisuuksia sekä mahdollisia tuholaisia tai tauteja. Parhaan vesiviljelykulttuurin valitseminen on tärkeää, koska järjestelmät ovat kalliita perustaa ja ylläpitää.
Hydroponinen kulttuuri on maaperätön puutarhanhoitotekniikka, joka toimittaa kasvin juuret esisekoitetulla ravinneliuoksella. Parhaan vesiviljelykulttuurin valitsemiseksi henkilön on otettava huomioon useita tekijöitä, kuten kasvatettavat kasvit. Monet orkideanviljelijät käyttävät vesiviljelyä, koska se jäljittelee orkideoiden luontaista ympäristöä. Hydroponisen järjestelmän valinta riippuu myös henkilön asiantuntemuksesta, koska jotkut ovat hankalia hallita.
Helpoin järjestelmä aloittelijoille on passiivinen tekniikka. Jotkut ihmiset viittaavat siihen itsekastavana ruukuna, koska mikään mekaaninen järjestelmä ei anna ratkaisua kasvin juurille. Viljelijät kasvattavat kasveja ravinteikkaassa väliaineessa, kuten hiekassa tai kiviaineksessa. Usein kasvit tulevat juuriin ja happea nälkään; siksi tämä tekniikka tuottaa alhaisimman tuotantomäärän.
Toinen suosittu järjestelmä on tulva- ja viemäröintitekniikka. Tässä järjestelmässä viljelijä nostaa kasvit alustalle erityiselle pöydälle, jonka hän tulvaa liuoksella. Kasvit imevät mahdollisimman paljon ravinteita ja sitten ylimääräinen valuu säiliöön tai jätesäiliöön. Useat tekijät, kuten kustannukset ja viljelijän asiantuntemus, määrittävät, onko tämä paras viljelijä vesiviljelylle. Jotkut väliaineet, kuten kivivilla tai mineraalivilla, ovat kalliita.
Syvävesitekniikka on vesiviljelytekniikka, jota aloittelijat voivat harkita. Tässä tekniikassa kasvualustalla täytetty tarjotin istuu liuoksella täytetyn säiliön päällä. Pumppu pakottaa ilman ilmakivien läpi hapettamaan liuoksen, mutta syvän veden tekniikka ei käytä pumppua liuoksen kierrättämiseen. Yksi tämän vesiviljelytekniikan haitoista on, että se vaatii paljon tilaa.
Tippa- tai sprinklerijärjestelmä vaatii myös kiertovesipumpun. Liuos virtaa jatkuvasti juurien yli, ja joissakin järjestelmissä sprinklerit sumuttavat lehdet toimittaakseen enemmän ravinteita kasveille. Jotkut tämän järjestelmän haitoista sisältävät tukkeutuneet suuttimet, vuotavat letkut ja suolan kertyminen kastelujärjestelmään. Järjestelmän vika kuivattaa kasvit nopeasti, koska juuret ovat avoimesti näkyvissä. Yleensä asiantuntijat eivät suosittele tätä järjestelmää aloittelijoille, mutta tuotto on suurempi.
NFT -järjestelmä on tuottavin, mutta monimutkaisin. Viljelijä ei käytä väliainetta kasvien kiinnittämiseen tai liuoksen pitämiseen paikallaan. Hän asettaa kasvit kaulapantaan kaltevassa, avoimessa kourussa tai suljetussa putkessa, jolloin juuret voivat virrata vapaasti kouruun tai putkeen. Liuos virtaa jatkuvasti juurien yli. Kasvattajan on oltava ahkera pitääkseen pumpun käynnissä, muuten kasvien juuret kuivuvat ja kuolevat.