Suurin osa merestä on täysin pimeää. Tätä kutsutaan aphoottiseksi vyöhykkeeksi, ja se alkaa noin 3,000 km: n syvyydestä ja jatkuu pohjaan, joka yleensä ulottuu noin 0.9 km: n syvyyteen, lukuun ottamatta valtamerihautoja, jotka voivat olla jopa 18,000 km syvä. Tällä vyöhykkeellä fotosynteesi ei voi tapahtua, joten ravintoverkkojen, kasvien ja syanobakteerien tavanomainen perusta puuttuu. Sen sijaan eläinten on elettävä ylhäältä putoavista ruhoista, muista eläimistä ja joissakin harvinaisissa tapauksissa bakteereista, jotka käyttävät kemiallisia energialähteitä, kuten sulfideja ja metaania. Joitakin aphoottisella vyöhykkeellä eläviä eläimiä ovat ankerias, jättimäinen kalmari, pienemmät kalmarit, merikrot, vampyyri -kalmari ja lukuisat meduusat.
Aphoottinen vyöhyke on jaettu kahteen tasoon: bathypelaginen vyöhyke ja syvänmeren alue. Bathypelaginen vyöhyke ulottuu noin 3,300 km: n (1 13,000 jalkaa) pinnan alapuolelta 4 400 jalkaan (XNUMX km) alapuolelle. Tämän alapuolella on syvänmeren alue, jota kutsutaan myös syvävyöhykkeeksi, jossa paineet ovat erittäin korkeat (XNUMX ilmakehää ja enemmän) ja biologinen monimuotoisuus vähenee jyrkästi. Tämän alapuolella on hadopelaginen vyöhyke, jota käytetään viittaamaan valtameren kaivantoihin.
Jotkut maailman rumin ja pahimman näköisistä kaloista löytyvät näistä valtameren osista, mukaan lukien kyykäärme, hammashammas, lohikäärme, liskokala ja monet muut. Näillä kaloilla on usein saranoidut leuat, mustat asteikot, lävistävät silmät ja erittäin terävät hampaat. Useimmat ihmiset eivät halua törmätä heihin pimeässä tulvassa kujalla. Jotkut heistä on nimetty niiden pinnallisen samankaltaisuuden mukaan matelijoihin.
Monet aphoottisen vyöhykkeen eläimistä ovat bioluminesoivia, mikä tarkoittaa, että he voivat tuottaa oman valonsa tavalla tai toisella. Tätä voidaan käyttää sekä navigointiin että pienten eläinten houkuttelemiseen leukojen päälle. Onkijakala on luultavasti tunnetuin esimerkki, sillä sen vieressä on viehe, joka ulkonee suunsa edestä erityisestä lisäyksestä päässään.
Muut kalat eivät näytä niin pahoilta kuin möykkyiltä. Näitä pohjasyöttölaitteita ovat osuvasti nimetty möykkykala ja arkkukalat, jotka kulkevat merenpohjaa pitkin jalkojen kaltaisten evien avulla. Alareunasta löytyy myös merikurkkuja ja jättiläisiä isopodeja, jalkapallon sukulaisia. Syvänmerellä on myös lukuisia epätavallisia ja harvinaisia haita, kuten Megamouth Shark, jota pidetään yhtenä viime vuosisadan vaikuttavimmista merieläinten löydöistä.