Acidophilus on hyvien bakteerien kanta, jota usein kutsutaan probiooteiksi ja jota tarvitaan sekä ihmisten että eläinten terveelliseen ruoansulatukseen ja immuunitoimintaan. Yksi yleinen syy acidophiluksen käytölle koirille on helpottaa ruoansulatusongelmia, kuten ummetusta tai kaasua, joita voi esiintyä lemmikkieläimessä. Jos koira ei saa riittävästi arvokkaita ja luonnollisia probiootteja ruokavaliossaan, eläinlääkäri tai lemmikkieläinten ravitsemusterapeutti saattaa määrätä acidophilus -lisäravinteita. Koska probiootit, kuten acidophilus, voivat auttaa lisäämään immuunijärjestelmän toimintaa, jotkut koiranomistajat käyttävät acidophilusta koirille ja pennuille kevyen sairauden aikana.
Kun koiran ruokavalio ei ole ihanteellinen tai koira ei pysty sulattamaan oikein nautittua ruokaa, monet eläinlääkärit määräävät probiootteja. Yleisin koirien probiootti on acidophilus, joka on tietty probioottikanta, joka on tärkeä suolen terveydelle ja yleiselle hyvinvoinnille. Jos ruoansulatus on huono ja koiralla on ummetusta tai kroonista kaasua, tämä voi johtaa ravinteiden virheelliseen imeytymiseen ruoasta ja lopulta joidenkin eläinten ravitsemukselliseen puutteeseen. Acidophiluksen käyttö koirille on joskus ensimmäinen askel ruoansulatusongelmien ratkaisemisessa sekä luonnollisissa että tavanomaisissa eläinlääkäriklinikoissa.
Koirat ja pennut, jotka eivät jostain syystä syö asianmukaista ruokavaliota, eivät välttämättä käytä tarpeeksi probiootteja pitääkseen suoliston terveenä. Ruokavalio, jossa on runsaasti jalostettuja jyviä ja tärkkelystä, jotka ovat yleisiä monille kuiville koiranruoille, sisältävät pieniä määriä probiootteja, jos niitä on, ellei niitä ole lisätty luonnollisilla probiooteilla, kuten acidophilus. Ei ole harvinaista, että acidophilus koirille on saatavana elintarvikkeena, jotta vältetään ongelmat, joita saattaa ilmetä, kun koira yrittää niellä pillerin tai kuluttaa vieraan nestemäisen lisäaineen. Joskus ehdotetaan, että tietyt vihannekset, kuten parsakaali tai porkkana, voivat sisältää tarvittavia probiootteja, mutta määrät ovat edelleen melko pieniä näissä elintarvikkeissa.
Terveet koirat voivat tuottaa omia hyödyllisiä bakteereja, joten acidophilus koirille ei välttämättä ole ongelma muista tekijöistä riippuen. Näitä tekijöitä voivat olla antibioottien käyttö infektioihin, koska antibiootit voivat tuhota koiran kehon näistä hyvistä bakteereista. Tämä on toinen syy, miksi jotkut eläinlääkärit neuvovat käyttämään acidophilus -lisäravinteita tai väkevöityä probioottiruokaa koiran varastojen täydentämiseksi. Kun koira kärsii lievästä sairaudesta, joka vaatii vain lepoa toipuakseen, koiralle saatetaan suositella acidophiluksen tai muun probiootin nauttimista, koska probioottien on osoitettu lisäävän immuunijärjestelmän toimintaa.