Yleisimmät sinisen mätän syyt on sidottu pseudomonas aeruginosa -bakteeriin. Tämä infektio ilmenee yleensä kohtalaisissa tai vaikeissa iho- ja pehmytkudosvammoissa, kuten toisen tai kolmannen asteen palovammoissa. Se voi myös joskus olla vastuussa virtsatieinfektioista, jotka johtuvat katetrin virheellisestä käytöstä. Mätän sininen väri johtuu pseudomonas aeruginosa -bakteerin sivutuotteesta, jota kutsutaan pyosyaniiniksi. Vaikka tätä bakteeria esiintyy usein ei-tarttuvissa kolonisaatioissa eri pinnoilla, se voi joskus olla vakavaa, kun se tunkeutuu avoimiin haavoihin ihmisillä, joilla on heikentynyt immuunijärjestelmä.
Sininen mätä esiintyy usein suljetussa paiseessa, jonka koko voi vaihdella infektion laajuudesta riippuen. Tämäntyyppinen mätä voi vaihdella väriltään tummansinisestä vaaleampaan siniseen sävyyn riippuen pyosyaniinin määrästä. Tämä aine toimii luonnollisena antibioottina, joka yrittää neutraloida pseudomonas aeruginosaa, kun muun kehon immuunipuolustus on ollut tehoton. Jatkuva haava, jossa on sininen mätä ja joka ei parane, viittaa yleensä heikentyneeseen immuunijärjestelmään ja vaatii usein jatkuvaa lääketieteellistä hoitoa suun kautta otettavilla tai ajankohtaisilla lääkkeillä.
Edistynyt pseudomonas aeruginosa -infektio voi joskus johtaa vihreään ja siniseen mätäen, ja tämä väri osoittaa joskus toisen myeloperoksidaasi -nimisen antibakteerisen proteiinin läsnäolon. Sekä tämä proteiini että pyosyaniini auttavat valkosoluja puhdistamaan tarttuvat bakteerit nauttimalla hyökkääviä mikrobeja. Aivan kuten muuntyyppiset infektiot, valkosolut lopulta kuolevat ja kerääntyvät neutraloidun tarttuvan aineen kanssa muodostaen mätä. Lääketieteelliset tutkijat raportoivat joskus, että pseudomonas aeruginosaa sisältävät mätälaboratorioviljelmät voivat tuottaa outoa hajua, joka on samanlainen kuin käyville rypäleille.
Useimmat haavat, joissa on sininen mätä, voidaan parantaa onnistuneesti pitämällä loukkaantunut paikka puhtaana ja peitettynä tulehdusten estämiseksi. Lääkärit havaitsevat usein, että paikalliset salisyylihappoa sisältävät lääkkeet ovat erityisen tehokkaita taistelemaan pseudomonas aeruginosa -bakteereja vastaan. Jotkut tapaukset, joissa pseudomonas aeruginosa on hyökännyt sisäelimiin, tarvitsevat hoitoa vahvempien antibioottikuurien avulla. Koska tämä bakteerilaji voi selviytyä muilla kuin biologisilla pinnoilla, sitä voi joskus esiintyä lääketieteellisissä laitteissa, kuten hengityssuojaimissa, ja se voi aiheuttaa infektioita, mukaan lukien keuhkokuume sairaalapotilailla. Pseudomonas aeruginosan aiheuttamalle keuhkokuumeelle on usein ominaista vihreän tai sinisen mätän karkottaminen keuhkoista, ja lääkärit korostavat, että nämä tapaukset ovat täysin estettävissä asianmukaisella laitteiden steriloinnilla.