Ensisijaiset syyt kalan kuolemaan ovat vammat ja sairaudet. Aggressiivinen säiliökumppani tai terävä säiliön koriste, joka on poistettava, voi loukkaantua kalasta. Monet taudit voivat vaikuttaa akvaariokaloihin, tavallisesta fin -rotista vesipisaroihin, tautiin, joka aiheuttaa kalojen turvotuksen. Kalasairaudet ovat yleensä ilmeisiä, koska ne muuttavat merkittävästi kalan ulkonäköä tai johtavat siihen, että kala ei enää syö tai ui kunnolla. On mahdollista inhimillisesti lopettaa kala niin, että se kärsii hyvin vähän tai ei lainkaan.
Jotkut akvaariokalat ovat erittäin aggressiivisia ja ne on pidettävä yksin, tai muuten ne hyökkäävät säiliökumppaneitaan, kunnes ketään ei jätetä eloon. Jopa normaalisti oppivat kalat voivat hyökätä toisiaan vastustajan kuolemaan asti. On tavallista, että osittain aggressiiviset kalat vahingoittavat toisinaan toista kalaa. Nämä vammat paranevat usein ilman väliintuloa, vaikka yleensä suositellaan loukkaantuneiden kalojen erottamista hyökkääjistä. Kaikilla kalakamppailuilla ei kuitenkaan ole onnellisia loppuja, ja voi olla tarpeen lopettaa vakavasti loukkaantunut kala, joka kärsii vain sen väistämättömään kuolemaan saakka.
Muutamat virustaudit vaikuttavat usein kotikalaan ja ne voidaan yleensä havaita melko helposti. Esimerkiksi kalarokko voidaan yleensä havaita harmaan tai vaaleanpunaisen kasvun ilmestymisellä kalan vartaloon. Lisäksi lymfosystit, jotka ovat usein huonojen elinolojen aiheuttamia, voidaan usein havaita ruskeiden syylien kaltaisten kasvujen esiintymisestä. Toinen tila, nimeltään Hexamita, on loisten aiheuttama ja sille tyypillistä on, että kalat muuttuvat väsyneiksi ja niiden päihin tulee vaurioita. Kun kala kokee tämän tilan, se yleensä pienenee visuaalisesti pienemmäksi huonon terveyden vuoksi.
Kynsiöljyä pidetään usein inhimillisimpänä ja yksinkertaisimpana tapana lopettaa kala. Tämä öljy on aine, joka voidaan lisätä kalan akvaarioon ja jos se annostellaan oikein, kala menettää tajuntansa. On pidettävä mielessä, että kynsiöljyn käyttäminen yksin tähän tarkoitukseen on vaikeaa, koska sitä tarvittaisiin suuri määrä. Sen sijaan alkoholipitoista ainetta, kuten vodkaa, voidaan lisätä akvaarioon sen jälkeen, kun kala on nukutettu neilikkaöljyllä. Riippumatta siitä, mitä menetelmää käytetään, on tärkeää varmistaa, että kala on todella kuollut eikä vain nukkunut, ja nukuttaa ja lopettaa kala asianmukaisessa järjestyksessä.