Riippumatta siitä, miten nimi lausutaan, tomaatti voi tulla moniin lajikkeisiin, joissa on laaja valikoima kokoja ja värejä. Tomaatit olivat keltaisia ja oransseja tomaatinviljelyn alussa, ja punainen väri tuli yleisemmäksi monien vuosien jalostamisen aikana. On satoja erityyppisiä tomaatteja värillisissä lajikkeissa, mukaan lukien punainen, oranssi, keltainen, valkoinen, vihreä, violetti ja musta. Joitakin tomaatteja, kuten perintöä ja kirsikkaa, on myös monia lajikkeita.
Monet pitävät punaisia tomaattilajikkeita suosituimpina, mukaan lukien Beefsteak ja Roma -tomaatit. Kun monet ihmiset ajattelevat tomaatin makua, he yhdistävät sen tämän lajikkeen makuun. Vaaleanpunaisilla lajikkeilla on samanlaiset maut kuin punaisilla, mutta jotkut pitävät niitä vähemmän vilkkaina. Joitakin vaaleanpunaisia tyyppejä ovat Pink Girl ja Brandywine.
Oransseja tomaattilajikkeita ovat Persimmon ja Mountain Gold. Tämä tyyppi on tyypillisesti makeampi kuin punaiset tomaatit ja maistuu yleensä enemmän kuin hedelmät korkeamman sokeripitoisuuden vuoksi. Keltaiset lajikkeet ovat samanlaisia kuin oranssit ja ovat yleensä vähemmän kirpeitä kuin punaiset tomaatit. Tähän tomaattilajikkeeseen kuuluvat Golden Boy ja Garden Peach. Vihreät tomaattilajikkeet kypsyvät vihreinä ja niiden happamuus on yleensä pienempi kuin punaisilla tomaateilla.
Jotkut harvinaiset lajikkeet ovat valkoisia tomaatteja, jotka ovat tyypillisesti kaikkien tomaattien alhaisimpia happopitoisuuksia, ja jotkut ihmiset pitävät niitä lempeinä. Niihin kuuluvat Ghost Cherry ja Snow White. Violetilla ja mustalla tomaattilajikkeella on yleensä vahvempi ja savuisempi maku kuin punaisella tomaatilla, ja niihin kuuluvat Cherokee Purple ja Black Krim.
Useimmissa värillisissä lajikkeissa on myös vaihteluja avoimessa pölytyksessä tai hybriditomaattikasveissa sekä määräävissä tai epämääräisissä kasvumalleissa. Avoimet pölytetyt lajikkeet säilyttävät emokasvin ominaisuudet vuosittain. Siitepölyn ottaminen yhdestä pölytetystä tomaatista ja sen asettaminen toiseen jo pölytettyyn tomaattiin luo tyypillisesti hybriditomaattilajikkeen.
Määrittävillä tomaattilajikkeilla on yleensä kompakteja pensaita tai kasveja, ja ne lopettavat tyypillisesti kasvunsa, kun hedelmät kypsyvät. Niiden tomaatit kypsyvät yleensä saman ajanjakson aikana, yleensä kahden viikon ajan, ja sitten ne kuolevat. Jotkut kutsuvat määrittelemättömiä lajikkeita viiniköynnöstomaateiksi. Niiden tiedetään edelleen kasvattavan ja tuottavan hedelmiä, kunnes pakkanen tappaa heidät, ja hedelmät kukkivat aina kauden aikana.
Suunnitellessaan kasvattaa tomaatteja vihannespuutarhassa, monet ihmiset tutkivat, millainen lajike kasvaa parhaiten alueellaan. He istuttavat useita tomaatteja samaan puutarhaan nähdäkseen, mitkä lajit kasvavat ja maistuvat paremmin. Valittavana on monia lajikkeita ja monia paikkoja ostaa siemeniä, mukaan lukien lukuisia online -resursseja.