Yleisimmät välityspalvelimen asetukset koskevat suoria Internet -yhteyksiä, automaattista tunnistusta ja manuaalista määritystä. HTTP -välityspalvelimen välityspalvelimet ja SOCKS, verkon välityspalvelinprotokolla, välityspalvelimet voidaan myös valita. Muita asetuksia ovat välimuistin tyhjentäminen ja suojattu sidonta.
Suoran yhteyden asetusta käytetään, kun käyttäjä haluaa käyttää Internetiä suoraan, vaikka selain on määritetty välityspalvelimen käyttöön. Se on yksi yksinkertaisimmista ja yleisimmistä välityspalvelimen asetuksista, ja se on kätevä ominaisuus, kun käyttäjän on vaihdettava todellisen IP -osoitteen ja välityspalvelimen välillä. Kun tätä asetusta käytetään, välityspalvelin ohitetaan.
Välityspalvelimen asetukset voidaan myös tunnistaa automaattisesti. Kun verkkotietokoneiden on käytettävä samoja välityspalvelinasetuksia, voidaan määrittää palvelin ja luoda erityinen profiili .ins- ja .cab -tiedostojen avulla. Tämä on nopea ja helppo tapa hallita välityspalvelinasetuksia yhdestä keskustasta, koska tietokoneet tunnistavat automaattisesti oikeat asetukset.
Manuaalisen määrityksen avulla käyttäjät voivat syöttää välityspalvelimen asetukset käsin. Tätä toimintoa voi yleensä käyttää Internet -selaimen “Työkalut” -valikon kautta. Asetuspaneeli tarjoaa vaihtoehdon, jossa ei ole välityspalvelinta, automaattinen tunnistus, järjestelmän välityspalvelinasetukset ja manuaalinen määritys. Jos manuaalinen määritys on valittu, käyttäjä voi valita käytettävän välityspalvelimen tyypin. Oikeat tiedot voidaan sitten lisätä kokoonpanon viimeistelemiseksi.
Käyttäjät saavat usein valita HTTP -välityspalvelimien tai SOCKS -välityspalvelimien välillä, varsinkin kun käytetään välityspalvelinohjelmistoa. Käyttäjä syöttää välityspalvelimen osoitteen ja portin. Jos se on suojattu välityspalvelin, ohjelmisto pyytää käyttäjää syöttämään myös käyttäjänimen ja salasanan.
Välimuistin tyhjentäminen on toinen välityspalvelimen asetus. Se suojaa käyttäjätietoja tallennettujen salasanojen tapauksessa. Jotkin välityspalvelimen ohjelmistopaketit tarjoavat myös mahdollisuuden tyhjentää evästeet ja väliaikaiset selaintiedostot sen jälkeen, kun käyttäjä on katkaissut yhteyden välityspalvelimeen.
Jotkin välityspalvelinohjelmistopaketit tarjoavat myös suojatun sidonta -asetuksen. Kun tämä on käytössä, käyttäjä on suojattu, vaikka välityspalvelin epäonnistuu. Tämä asetus katkaisee Internet -yhteyden, jos välityspalvelin lakkaa toimimasta käytön aikana ja estää käyttäjän todellisen IP -osoitteen paljastamisen. Tämä on kätevä ominaisuus suojattuja sivustoja käytettäessä tai kun IP -osoite ”vuotaa”.