Aivojen limbisessä järjestelmässä sijaitseva amygdala on aivojen rakenne, joka osallistuu emotionaalisten ärsykkeiden käsittelyyn ja sitoutuu muistiin. Amygdala -vaurioilla voi olla useita erilaisia vaikutuksia, mukaan lukien kyvyttömyys luoda tai toteuttaa pelon vastauksia tiettyihin ärsykkeisiin. Vaikutuksiin voi kuulua myös äidin käyttäytymisen vähentyneitä ilmaisuja. Riskialttiita käyttäytymismalleja, kuten uhkapeliä huonoilla kertoimilla, voidaan myös lisätä tämän aivojen alueen vaurioitumisen jälkeen.
Normaalisti amygdala auttaa aivoja koodaamaan ja ilmaisemaan pelon vastauksia. Altistumisen jälkeen uhkaaville ärsykkeille aivot muistavat nämä olosuhteet, ja ärsykkeen uusi esiintyminen saa aikaan pelkoreaktion. Jotkut vauriot sammuttavat tämän vastauksen kokonaan. Henkilö, jolla on tämä vahinko, ei yhdistä pelkureaktioita ärsykkeisiin. Aiemmin hankittuja pelkovasteita ei myöskään ilmaista ärsykkeiden läsnä ollessa.
Muita tunteita kuin pelkoa välitetään tällä alueella. Apinoissa tehdyissä tutkimuksissa amygdala -vauriot saivat äidit lopettamaan äidin käyttäytymisen. Äidit hyökkäsivät tai käyttivät hyväkseen lapsiaan, joissakin tapauksissa. Vaurioita koko amygdala molemmin puolin aivoja johti Kluver-Bucy oireyhtymä apinoilla. Tämä häiriö aiheuttaa aggression ja pelon puutteen sekä sopimattoman seksuaalisen käyttäytymisen.
Henkilöiden auttaminen tunnistamaan tunteet on toinen toiminto, johon vauriot voivat vaikuttaa. Ihmiset, joilla oli amygdala -vaurioita aivojen molemmilla puolilla, eivät kyenneet tunnistamaan ilmeisiin liittyviä tunteita. Joskus he jopa sekoittivat vihaiset ilmeet hymyyn. Kun näille henkilöille näytettiin emotionaalisia ilmaisuja ilman kasvoja, he pystyivät tunnistamaan esitetyt tunteet. Tämä tulos osoittaa, että aivoilla on muita keskuksia, jotka auttavat yksilöitä tunnistamaan tunteet.
Tappion karttaminen on termi, joka kuvaa riskien ottamisen välttämistä, varsinkin kun nämä riskit eivät johda merkittävään voittoon. Amygdala -vauriot ihmisillä loivat kyvyttömyyden harjoittaa tappio -vastenmielisyyttä. Näillä ihmisillä oli taipumus ottaa suuria riskejä uhkapelissä, vaikka he eivät ansaitsisi paljon rahaa voittamisesta. Se ei vaikuttanut riskinottoon, jolla ei ollut mahdollisuutta yksittäisen menettämään jotain.
Muiden ihmisten havaitseminen henkilökohtaisessa tilassa on toinen amygdalan toiminto, johon se voi vaikuttaa. Kun amygdala on vaurioitunut aivojen molemmille puolille, ihmiset eivät reagoi muihin, jotka seisovat henkilökohtaisessa tilassaan. Tämä vaikutus voi johtua siitä, että yksilöt eivät erota toistensa vieressä seisomista ja jonkin matkan päässä heistä.