Biodiesel on merkittävä vaihtoehtoisen energian lähde, joka on valmistettu vihreistä ja kestävistä raaka -aineista. Biodieselin etuna on se, että se vähentää riippuvuutta fossiilisista polttoaineista, tuottaa vähemmän saastumista ja on uusiutuvaa. Yksi biodieselin haitoista on syntyvän jätteen määrä. Biodieselin jäte koostuu pääasiassa glyserolista, joka tunnetaan myös nimellä glyseriini, ja metanolista, ja pieniä määriä muita epäpuhtauksia. Vaikka glyseroli on vaaratonta ja mahdollisesti hyödyllistä, biodieselin tuotannossa syntyvä jäte on heikosti puhdasta ja metanolin ja muiden aineiden läsnäollessa käyttökelvottomaksi ja myrkylliseksi.
Biodieselpolttoaineen valmistukseen kuuluu prosessi, joka tunnetaan nimellä transesteröinti, jossa kasviöljy saatetaan reagoimaan metanolin kanssa käyttämällä katalyyttinä natrium- tai kaliumhydroksidia, jolloin saadaan rasvaestereiden seos, joka sisältää biodieseliä. Tämän reaktion toinen tuote on glyseroli. Tyypillisesti yksi osa glyserolia tuotetaan jokaista kymmenestä biodieselin osasta. Käytännössä useimmat biodieselin tuottajat käyttävät jopa kaksi kertaa enemmän metanolia kuin reaktiossa periaatteessa vaaditaan sen varmistamiseksi, että kaikki öljy muunnetaan. Jäljelle jäänyt glyseroli sisältää siksi suuren osan metanolia ja pieniä määriä saippuaa, joka syntyy katalyytin reaktiosta kasviöljyn kanssa.
Metanoli voidaan ottaa talteen tislaamalla ja käyttää uudelleen; jäljelle jäänyt glyseroli sisältää kuitenkin edelleen metanolin ja muiden epäpuhtauksien jäämiä. Glyserolin puhdistaminen myyntikelpoiseksi on kallista, ja vuodesta 2011 lähtien tällä tavalla tuotetaan niin paljon glyserolia, että sille on vaikea löytää markkinoita. Tämä tarkoittaa, että biodieselin tuottajille voidaan jättää suuria määriä heikkolaatuista glyserolia hävitettäväksi. Myrkyllisten epäpuhtauksien vuoksi sitä ei voi huuhdella pois, levittää maahan tai haudata kaatopaikoille, ja tuottajat saattavat joutua maksamaan sen poistamisesta.
Biodieseljätteen käyttö on haasteellista, mutta vuodesta 2011 lähtien on tehty useita ehdotuksia. Yksi ajatus on käyttää tavallisen E. coli -bakteerin kantaa muuntaakseen glyserolijäte käymisen avulla sukkinaateiksi ja formiaatteiksi – kemikaaleiksi, joilla on laaja käyttöalue. Toinen ehdotus on yhdistää biodieselijäte maatalouden biomassajätteeseen kiinteän polttoaineen tuottamiseksi – tämän etuna on kahden jätetuotteen uudelleenkäyttö. Glyserolijätteen käyttöä yhdessä muiden biomassatuotteiden kanssa raaka -aineena polyuretaanivaahdon valmistuksessa on ehdotettu halpaksi tapaksi valmistaa tämä laajalti käytetty tuote. Kokeet ovat vahvistaneet, että Schizochytrium limacinum -niminen levälaji voi muuttaa raakaglyserolin dokosaheksaanihapoksi (DHA), eräänlaiseksi omega-3-monityydyttymättömäksi rasvahapoksi, jolla on tunnettuja terveyshyötyjä ihmisille-tämä tarjoaa uuden mahdollisuuden hyödyntää biodieseljätettä.