Elinympäristön ennallistamisella tarkoitetaan hankkeita, joiden tarkoituksena on täydentää ekosysteemin luonnonvaroja luonnon- tai ihmisen aiheuttamien vahinkojen jälkeen. Joissakin tapauksissa elinympäristön palauttaminen on kriittisen tärkeää kotoperäisten lajien säilymisen, maaperän tai veden eheyden ja luonnollisen ekosysteemin olemassaolon kannalta. On olemassa monia erilaisia luontotyyppien palauttamistyyppejä, mukaan lukien metsitys, rantojen puskurointi, preerian palauttaminen ja koralliriuttojen ennallistaminen. Kaikenlainen elinympäristöjen kunnostaminen voi auttaa varmistamaan ekosysteemien tulevaisuuden, jotka ovat olleet olemassa joissakin tapauksissa tuhansien vuosien ajan.
Uudelleenmetsitykseen kuuluu alkuperäisten puiden, pensaiden ja ruohojen istuttaminen metsäalueen palauttamiseksi. Uudelleenmetsitys voi olla tarpeen sen jälkeen, kun alueella on tehty laajat hakkuut tai luonnonkatastrofi, kuten metsäpalo. Jos eläinlajeja on kadonnut tai niiden määrä on vähentynyt huomattavasti metsäalueelta metsien hävittämisen vuoksi, metsityshankkeisiin voi sisältyä yrityksiä tuoda lajit takaisin luontoon, usein vankeudessa olevista yksilöistä. Koska ekosysteemi on usein riippuvainen kehittyneestä vuorovaikutusjärjestelmästä kotoperäisten eläinten ja kotoperäisten kasvien välillä, on tärkeää, että metsityshankkeet pyrkivät palauttamaan lajien luonnollisen tasapainon sen sijaan, että tuodaan eksoottisia kasveja tai eläimiä uuteen ympäristöön.
Riparian puskurointi on luontotyyppien ennallistamistyyppi, joka varmistaa luonnollisten vesilähteiden eheyden ja olemassaolon. Rannan puskuri on kivien ja kasvien vyö, joka kulkee joen tai puron rajojen rinnalla. Kasvillisuus pitää puron tai joen veden vapaana sedimentistä luomalla kiinteän esteen helposti murenevan maaperän sijasta. Rannan puskurivyöhykkeiden palauttaminen rakennushankkeiden, metsien hävittämisen tai tulvien jälkeen voi auttaa varmistamaan, että luonnolliset vesilähteet pysyvät elinkelpoisina ekosysteemissä.
Pohjois -Amerikassa mikään elinympäristö ei ole nähnyt niin paljon tuhoa kuin suuret preeriat, jotka ulottuvat Yhdysvaltojen ja Kanadan keskelle. Vaikka kehitetty preeriamaa sallii monet maatiloista, jotka auttavat ruokkimaan maailmaa, ainutlaatuisilla lajeilla ja eduilla tuhoutuneilla eduilla voi olla merkittävä vaikutus ympäristöön. Historiallisesti preeriat ovat olleet täynnä korkeita ruohoja ja luonnonvaraisia kukkia, jotka mahdollistavat mehiläisväestön edistämisen yhdessä monien muiden lajien kanssa. Ilman mehiläisiä ristipölytys on lähes mahdotonta, mikä tekee kestävien kasvien kasvattamisesta valtavan haasteen. Prairien elinympäristön ennallistaminen pyrkii muuttamaan heikentyneet tasangot kukka- ja kotiruohoympäristöiksi, jotka voivat tukea mehiläisiä sekä monia uhanalaisia preerialajeja.
Koralliriutat ovat ylivoimaisesti suurimmat elämän lähteet meressä. Tuhannet meren kasvi- ja kalalajit asettuvat koteihinsa laajojen riuttojen keskelle, jotka ovat elämän ja virkistyksen keitaita merimaiseman suurilla karuilla alueilla. Coral on herkkä lämpötilan muutoksille ja happamille tasapainoille, ja sitä tuhotaan usein kalastuskanavien luomiseksi tai kulutustavaroiden keräämisen kautta. Korallien elinympäristön palauttamisessa käytetään sekä synteettisiä koralleja että korallien uudelleensijoitusohjelmia sen varmistamiseksi, että riutat pysyvät täynnä elämää ja monimuotoisuutta.