Hammasimplanttien saamisen seurauksena voi ilmetä erilaisia ongelmia. Infektio voi levitä esimerkiksi implanttipaikan ympärille. Implantin huono sijoittaminen voi myös aiheuttaa hermokipua ja vaurioita. Jos implanttia ei ole asetettu oikein, se voi myös olla löysä tai epävakaa. Joissakin tapauksissa se voi rikkoutua ja se on vaihdettava, tai keho voi jopa hylätä sen.
Yksi melko yleisistä hammasimplanttien ongelmista on infektio. Bakteereja voi kerääntyä ikeniin implantin ympärille aiheuttaen kipua, turvotusta ja tulehdusta. Myös implantin ympärillä olevat hampaat voivat vaikuttaa, ja joissakin tapauksissa infektio voi aiheuttaa luukadon leuassa. Kun näin tapahtuu, alue on tyypillisesti puhdistettava ja käsiteltävä antiseptisellä suuvedellä tai antibiooteilla; vakavissa tapauksissa implantti on ehkä poistettava, jotta infektio voidaan poistaa ja paraneminen voi tapahtua.
Toinen hammasimplanttien ongelmatyypeistä voi olla, kun leuan hermo vaikuttaa. Jos implantti asetetaan hermolle tai sen lähelle, se voi painaa sitä ja aiheuttaa kipua tai vaurioita. Väärin sijoitetut implantit on yleensä poistettava ja asetettava uudelleen sopivampaan paikkaan.
Implantti, jota ei ole lujasti asetettu luuhun, voi myös olla heiluva ja löysä; tämä voi tapahtua eri syistä. Esimerkiksi ensimmäinen leikkaus ei ehkä ole tehty oikein tai luun määrä, johon implantti asetettiin, ei ehkä ollut riittävä pitämään sitä vakaana. Liiallinen muiden hampaiden paine implanttiin voi myös löystää sen. Tämäntyyppisten hammasimplanttien ongelmien yhteydessä tilanne on arvioitava ja käsiteltävä tarpeen mukaan, jotta implantti voidaan asettaa lujemmin.
Implantin täydellinen epäonnistuminen on toinen mahdollisista hammasimplanttiongelmista. Implanttien valmistukseen käytetty metalli, tyypillisesti titaani, voi taipua ja mahdollisesti jopa rikkoutua. Vaikka se ei ole kovin yleistä, hammaslääkärin on vaihdettava se uuteen implantin rikkoutuessa.
Hammasimplantti on vieras esine, joka työnnetään leukaan, ja joskus potilaan keho hylkää sen. Keho pitää sitä tunkeilijana eikä siksi halua sen olevan läsnä. Näissä tapauksissa potilaan oma keho voi itse asiassa työntää implantin ulos. Tässä tilanteessa potilaiden on ehkä harkittava muita vaihtoehtoja, koska heidän kehonsa todennäköisesti torjuu implanttien lisäämisen.