Lääkärit voivat määrätä ihmisen koriongonadotropiinia tai HCG: tä erilaisten lisääntymisjärjestelmään liittyvien sairauksien hoitoon. Kuten useimmilla muillakin lääkkeillä, tällä hoidolla on joitain sivuvaikutuksia, ja niillä on taipumus vaihdella miehillä ja naisilla. Urokset voivat huomata rintakudoksen laajentumisen, ylimääräisen häpy- tai kasvokarvojen, aknen, lisääntynyttä lisääntymiselintä tai äkillisen kasvun, joka johtaa korkeuden lisääntymiseen. Naiset voivat huomata ihmisen koriongonadotropiinin sivuvaikutuksia, kuten pahoinvointia, hengenahdistusta, ruoansulatushäiriöitä, turvotusta ja äkillistä painonnousua. Molemmat sukupuolet voivat myös havaita päänsärkyjen lisääntymistä, väsymystä, mielialan vaihteluita, kipua HCG: n pistoskohdassa tai allergista reaktiota.
Miehet voivat ottaa tämän lääkkeen ennen murrosiän alkamista, jotta kivekset putoavat ja edistävät testosteronin vapautumista, mutta ihmisen koriongonadotropiinin sivuvaikutuksia on etsittävä. Esimerkiksi joillakin miehillä voi esiintyä varhaista murrosikää, mikä voi johtaa kasvojen akneen, syvempään ääneen, suurentuneisiin kiveksiin ja penikseen sekä äkilliseen kasvojen ja häpykarvojen ilmaantumiseen. Gynecomastiaa, joka on rintakudoksen turvotusta miehillä, voi myös esiintyä, koska tämä tila ilmenee tyypillisesti joidenkin poikien murrosiässä. Äkillinen korkeuden nousu ja mielialan vaihtelut voivat myös näkyä tätä lääkettä käytettäessä. Näitä ihmisen koriongonadotropiinin sivuvaikutuksia pidetään harvinaisina, ja ota yhteys lääkäriin, jos niitä havaitaan.
Naisille voidaan määrätä tätä lääkettä hedelmättömyyden hoitoon, joten monet ihmisen koriongonadotropiinin sivuvaikutukset vaikuttavat yleensä vatsan ja munasarjojen alueisiin. Esimerkiksi lantion- ja vatsakipuja, turvotusta, ruoansulatushäiriöitä, pahoinvointia ja oksentelua voi esiintyä. Hengenahdistus ja äkillinen painonnousu ovat muita sivuvaikutuksia, jotka joskus näkyvät HCG: tä käyttävillä naisilla. Vakavampia komplikaatioita ovat epäselvä puhe, rintakipu, sekavuus ja heikkous vain yhdellä kehon puolella, jotka kaikki vaativat ensiapua.
Joitakin ihmisen koriongonadotropiinin sivuvaikutuksia voi esiintyä sekä miehillä että naisilla, jotka käyttävät tätä lääkettä, mukaan lukien turvotus tai kipu HCG -pistoskohdassa, päänsärky, väsymys ja mielialan vaihtelut. Vaikka nämä eivät yleensä vaadi välitöntä hätäapua, ne on ilmoitettava lääkärille mahdollisimman pian. Jotkut ihmiset huomaavat olevansa allergisia HCG: lle, koska he kehittävät ihottumaa, huimausta, hengitysvaikeuksia ja kutinaa. Turvotusta ja kutinaa esiintyy useimmiten kielellä tai kurkussa, kun allergia tälle lääkkeelle on ilmeinen. Nämä haittavaikutukset vaativat yleensä ensiapua.