Kajakkiperämoottorit sisältyvät yleensä retkikajakkeihin, ja niitä käytetään auttamaan veneen pitämisessä raiteessa vaikeiden vesien aikana. Peräsintä voidaan käyttää myös ohjaustarkoituksiin, ja kun sitä ei käytetä, se voidaan vetää vedestä ja asentaa veneen kannelle. Kajakkiperäsin toiminta ei vaihtele paljon, vaikka peräsin muoto voi muuttua valmistajan ohjeiden mukaan. Tapa, jolla peräsin nostetaan tai lasketaan veteen, voi myös vaihdella.
Peräsimen käyttö edellyttää köyden käyttöä kajakin ohjaamoon; tämän köyden avulla meloja voi laskea peräsimen veteen tai nostaa sen vedestä. Kajakki -peräsintä käännetään ohjaimessa olevilla polkimilla. Yhden polkimen painaminen kääntää peräsimen yhteen suuntaan ja toisen polkimen painaminen kääntää peräsimen toiseen suuntaan. Näitä polkimia käytetään joskus ohjaamoon asennettujen kiinteiden jalkapolkimien sijasta, vaikka muuntyyppiset kajakkiperäsimet, kuten Smart Track -peräsinjärjestelmä, käyttävät sekä kiinteitä jalkapylväitä että liikkuvia jalkapolkimia varmistaakseen, että melojalla on vankka paikka levätä hänen jalkansa, kun heijastavat ohjauksen aikana.
On mahdollista ja joskus ei kovin vaikeaa tehdä kajakin peräsin tyhjästä sen sijaan, että ostat esivalmistetun mallin. Peräsimen on oltava valmistettu kestävästä materiaalista, joka ei ole altis vesivahingoille; muovi on paras valinta, vaikka korkealaatuista muovia tarvitaan. Köydet ja polkimet voidaan myös räätälöidä toimimaan tietyn kajakin kanssa. Tällaisen peräsimen valmistusprosessi ei ole poikkeuksellisen vaikea, mutta rakentajan on oltava erityisen varovainen, jotta vene ei vahingoitu pysyvästi.
Suhteellisen uudenlainen peräsin on valmistettu hiilikuidusta. Tämä malli käyttää kevyttä jäykkää hiilikuitua peräsinmuotojen muodostamiseksi. Tämä on edullista, koska se säästää veneen kokonaispainoa ja on vähemmän altis vaurioille, jos peräsin törmää koviin esineisiin, kuten kiveen tai tukkiin. Nämä kajakkiperäsimet ovat paljon kalliimpia kuin muoviset peräsimet, vaikka ne kestävät todennäköisesti pitkään. Saatavana on myös metallisia peräsimiä, vaikka ne ovat harvinaisempia kuin muovi, koska metalli on yleensä raskas ja altis kosteusvaurioille.